I SA/Wr 224/26

WyrokWSA we Wrocławiu2026-06-03

Skład orzekający: Tadeusz Haberka, Łukasz Cieślak, Dagmara Stankiewicz-Rajchman

Analiza orzeczenia

Sekcja wygenerowana przez AI na podstawie treści orzeczenia — nie stanowi cytatu.

Zagadnienie prawne
Czy środki finansowe otrzymane przez uczelnię akademicką z Funduszu Polskiej Nauki na realizację zadania badawczego w ramach wirtualnego instytutu badawczego, które mają pokryć koszty badań i nie podlegają zwrotowi w przypadku braku efektu badawczego lub komercjalizacji, stanowią podstawę opodatkowania podatkiem od towarów i usług?
Ratio decidendi
Sąd uznał, że dofinansowanie z Funduszu Polskiej Nauki na realizację zadania badawczego ma charakter kosztowy i nie stanowi podstawy opodatkowania VAT. Dofinansowanie to nie wpływa bezpośrednio na cenę świadczonych usług ani nie jest wynagrodzeniem za konkretne świadczenie, ponieważ nie ma pewności co do powstania własności intelektualnej ani jej komercjalizacji, a środki nie podlegają zwrotowi w przypadku braku efektu. W konsekwencji, zaskarżona interpretacja indywidualna została uchylona w części dotyczącej opodatkowania tego dofinansowania.
Stan faktyczny
Skarżąca uczelnia akademicka uzyskała interpretację indywidualną Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej (DKIS) dotyczącą podatku VAT. Uczelnia wniosła o wydanie interpretacji w sprawie otrzymania środków z Funduszu Polskiej Nauki na realizację zadania badawczego w ramach wirtualnego instytutu badawczego. Środki te miały pokryć koszty badań, a ich zwrot nie był wymagany w przypadku braku efektu badawczego lub komercjalizacji. DKIS uznał, że otrzymane dofinansowanie oraz przyszłe wpływy z komercjalizacji stanowią wynagrodzenie za świadczoną usługę i podlegają opodatkowaniu VAT. Uczelnia nie zgodziła się z tą interpretacją, zarzucając naruszenie przepisów postępowania i prawa materialnego.
Rozstrzygnięcie
Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu uchylił zaskarżoną interpretację indywidualną w części stwierdzającej, że stanowisko strony skarżącej jest nieprawidłowe, oddalił skargę w pozostałej części i zasądził od Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej na rzecz strony skarżącej zwrot kosztów postępowania.

Pełny tekst orzeczenia

Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu w składzie następującym: Przewodniczący: Sędzia WSA Tadeusz Haberka Sędziowie: Sędzia WSA Łukasz Cieślak (sprawozdawca) Sędzia WSA Dagmara Stankiewicz-Rajchman Protokolant: Starszy specjalista Aleksandra Połaczewska po rozpoznaniu w Wydziale I na rozprawie w dniu 3 czerwca 2026 r. sprawy ze skargi P. W. na interpretację indywidualną Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej z dnia 30 grudnia 2025 r. nr 0113-KDIPT1-2.4012.983.2025.1.JS w przedmiocie podatku od towarów i usług I. uchyla zaskarżoną interpretację indywidualną w części stwierdzającej, że stanowisko strony skarżącej przedstawione we wniosku o jej wydanie jest nieprawidłowe; II. oddala skargę w pozostałej części; III. zasądza od Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej na rzecz strony skarżącej kwotę 697 zł (sześćset dziewięćdziesiąt siedem złotych) tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego. Przedmiotem skargi P. W. (dalej: skarżąca, wnioskodawca, strona) jest interpretacja indywidualna Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej (dalej: DKIS, organ) z 30 grudnia 2025 r. nr 0113-KDIPT1-2.4012.983.2025.1.JS w sprawie oceny skutków podatkowych opisanego zdarzenia przyszłego w podatku od towarów i usług. W złożonym 10 października 2025 r. wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej podano, że dotyczy on skutków podatkowych realizacji zadania badawczego pod nazwą: "[...]", akronim: "[...]". Podano dalej, że wnioskodawca jest publiczną uczelnią akademicką posiadającą osobowość prawną stanowiącą część systemu szkolnictwa wyższego w rozumieniu ustawy z dnia 20 lipca 2018 r. - Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce (Dz.U. z 2024 r. poz. 1571 ze zm.; dalej: u.p.s.w.n.). Wnioskodawca działa na podstawie powołanej ustawy, aktów wykonawczych do niej wydanych oraz statutu. Wnioskodawca jest zarejestrowanym czynnym podatnikiem podatku od towarów i usług. Działalność wnioskodawcy obejmuje zarówno obszar podlegający opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, obszar niepodlegający opodatkowaniu (będący poza zakresem VAT), jak również zwolniony z opodatkowania (czynności korzystające ze zwolnienia od podatku VAT). Działalność niepodlegająca opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług (będąca poza zakresem VAT) to przede wszystkim nieodpłatne czynności kształcenia oraz badania własne naukowe finansowane z subwencji, dotacji celowych oraz innych różnego typu dofinansowań. Odpłatna działalność wnioskodawcy to głównie odpłatne usługi kształcenia oraz odpłatne usługi noclegowe świadczone na rzecz studentów i doktorantów wnioskodawcy, które korzystają ze zwolnienia od podatku od towarów i usług, wnioskodawca prowadzi również działalność opodatkowaną podatkiem od towarów i usług, polegającą m.in. na odpłatnym wynajmie lokali użytkowych, odpłatnych badaniach wykonywanych na zlecenie, odpłatnych noclegach świadczonych na rzecz osób innych niż studenci/doktoranci, odpłatnej sprzedaży wydawnictw, czy też innej sprzedaży opodatkowanej tym podatkiem. Działalność opodatkowana podatkiem od towarów i usług to także tzw. komercjalizacja wyników badań (czyli sprzedaż wyników badań, odpłatne udzielanie licencji do wyników prac badawczych, rozwojowych, wdrożeniowych etc. lub też inne formy odpłatnego ich udostępniania). Kolejno wskazano, że zgodnie z art. 1 ustawy z dnia 4 kwietnia 2019 r. o wspieraniu działalności naukowej z Funduszu Polskiej Nauki (Dz.U. 2024 poz. 1554 ze zm.; dalej: ustawa o FPN), Fundusz Polskiej Nauki, zwany dalej "Funduszem", finansuje działalność naukową, o której mowa w art. 4 u.p.s.w.n., z wyłączeniem twórczości artystycznej, szczególnie ważną dla realizacji strategii rozwoju kraju służącą rozwojowi innowacyjnych produktów, zwaną dalej "działalnością naukową". Zgodnie z art. 5 ust. 1 ustawy o FPN, środki Funduszu przeznacza się na: 1) finansowanie zespołów badawczych prowadzących, w formie wirtualnego instytutu badawczego, działalność naukową w określonym obszarze wskazanym zgodnie z art. 6 ust. 1; 2) komercjalizację wyników pracy zespołów badawczych, o których mowa w pkt 1, lub know-how związanego z tymi wynikami. Na mocy art. 5 ust. 2 ustawy o FPN, wirtualny instytut badawczy stanowi formę organizacji pracy wyselekcjonowanych, konkurencyjnych na poziomie międzynarodowym zespołów badawczych, prowadzących działalność naukową o wysokim potencjale zastosowań społeczno-gospodarczych, pod kierunkiem lidera o uznanym dorobku naukowym, której celem jest komercjalizacja jej wyników. Wirtualny instytut badawczy jest finansowany ze środków Funduszu. Na podstawie art. 5 ust. 3 ustawy o FPN, wirtualnym instytutem badawczym zarządza podmiot wybrany przez ministra właściwego do spraw szkolnictwa wyższego i nauki. Dnia [...] lipca 2019 r. został wydany przez Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego komunikat o podmiocie zarządzającym wirtualnym instytutem badawczym. W komunikacie tym podano, że podmiotem zarządzającym wirtualnym instytutem badawczym w obszarze biotechnologia medyczna – [...] jest Sieć Badawcza Łukasiewicz – P. z siedzibą we W. (zwany dalej Instytutem P.). Następnie [...] maja 2023 r. wydano komunikat zmieniający i podano, że Instytut P. zarządza wirtualnym instytutem badawczym w obszarze biotechnologia medyczna. Do zadań podmiotu zarządzającego (czyli Instytutu P.) należy organizacja i przeprowadzanie otwartych konkursów ofert na wyłonienie zespołów badawczych, organizacja pracy ekspertów, podpisanie umów o finansowanie, nadzór i wsparcie realizacji zadań badawczych, dystrybucja środków funduszu, realizacja procesu komercjalizacji wypracowanych nowych technologii i produktów. Wskazano dalej, że Instytut P. poinformował o ogłoszeniu otwartego konkursu ofert (nr [...]) na wyłonienie zespołów badawczych prowadzących działalność naukową w formie wirtualnego instytutu badawczego (dalej także: WIB) w obszarze biotechnologia medyczna. Wnioskodawca wraz z trzema instytutami Państwowej Akademii Nauk oraz dwoma uniwersytetami zdecydowali się przygotować i złożyć wniosek w ww. konkursie. Przywołane podmioty zawarły umowę konsorcjum. Na mocy umowy konsorcjum wnioskodawca został upoważniony przez wszystkich członków konsorcjum do złożenia wniosku o dofinansowanie w imieniu konsorcjum, występowania w imieniu członków konsorcjum wobec Instytutu P. oraz innych podmiotów w związku z projektem, zawarcia w imieniu i na rzecz konsorcjum z Instytutem P. umowy o dofinansowanie projektu, a także reprezentowania członków konsorcjum w kontaktach z Instytutem P. w związku z wykonywaniem umowy. Każdy z konsorcjantów jest czynnym podatnikiem podatku od towarów i usług. Wnioskodawca zawrze z Instytutem P. umowę o finansowanie zespołu badawczego. Wzór umowy jest znany- stanowił załącznik do ogłoszenia otwartego konkursu ofert (nr [...]) na wyłonienie zespołów badawczych. Jeżeli dojdzie do pozytywnego rozstrzygnięcia konkursu, po zawarciu umowy projekt będzie wspólnie realizowany przez konsorcjum. Cel projektu to wspólna realizacja zadania badawczego pod ww. nazwą. W ramach projektu osoby zatrudnione przez wnioskodawcę oraz pozostałych członków konsorcjum (na podstawie umowy o pracę lub umowy cywilnoprawnej) będą wykonywać czynności zmierzające do realizacji wskazanego powyżej badania. Osoby te utworzą tzw. Zespół Badawczy i będą realizowały Zadanie Badawcze. Wszelkie wytworzone w ramach Zadania Badawczego wyniki działalności naukowej (w tym know-how związane z tymi wynikami) podlegające lub mogące podlegać ochronie prawnej (które przysługują członkom konsorcjum jako podmiotom zatrudniającym zespół badawczy - na podstawie umowy o pracę lub umowy cywilnoprawnej) staną się docelowo własnością Skarbu Państwa - Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego (dalej także: MNiSW). Podmiotem zobowiązanym i umocowanym do nabycia w imieniu i na rzecz MNiSW całości podlegających lub mogących podlegać ochronie prawnej wyników działalności naukowej (zwanych dalej własnością intelektualną) jest Instytut P. Instytut P., jako podmiot zarządzający w imieniu i na rzecz MNiSW, dokonuje wszelkich czynności jakie mają doprowadzić do skutecznej komercjalizacji powstałej w ramach projektu własności intelektualnej (rozumianej jako odpłatna sprzedaż praw, odpłatne udzielanie licencji do praw, czy inne odpłatne wykorzystanie wyników Zadania Badawczego), tj. wpierw do doprowadzenia do objęcia wyników ochroną prawną, a dalej(po uzyskaniu tej ochrony) do odpłatnej sprzedaży. Jeżeli z tytułu komercjalizacji (czyli sprzedaży zrealizowanej w imieniu i na rzecz MNiSW) uzyskane zostaną jakiekolwiek wpływy, to po pomniejszeniu o koszty jakie doprowadziły do tej komercjalizacji (sprzedaży): 1) 65% tych środków jest wypłacana twórcom, czyli bezpośrednio osobom fizycznym będącym członkami Zespołu Badawczego jakie wytworzyły lub współwytworzyły własność intelektualną (zgodnie z ich udziałem twórczym); 2) 15% tych środków jest przekazywana wnioskodawcy oraz pozostałym członkom konsorcjum 3) pozostała część środków trafia do Funduszu. Zarówno finansowanie Zadania Badawczego, jak i przyszła redystrybucja środków z komercjalizacji, odbywać się będzie z wykorzystaniem rachunku bankowego wnioskodawcy. Wnioskodawca będzie zobowiązany przekazać środki należne wskazanym podmiotom. Kolejno przedstawiono najważniejsze postanowienia umowy o finansowanie Zespołu Badawczego, jaka zostanie zawarta z instytutem P. Poprzez umowę o finansowanie wnioskodawca przyjmuje na siebie obowiązki i odpowiedzialność związane z realizacją umowy, a w szczególności Zadania Badawczego w ramach WIB, w tym realizacji Zadania Badawczego przez Zespół Badawczy, a Instytut P. zobowiązuje się do przekazania środków z Funduszu na finansowanie Zespołu Badawczego. Wskazane powyżej środki finansowe będą przekazywane wnioskodawcy z góry raz na kwartał zgodnie z harmonogramem płatności na podstawie wniosków o płatność. Wnioskodawca może przeznaczać środki finansowe z Funduszu tylko na wydatki kwalifikowalne i nie może ich używać w jakimkolwiek innym celu. Wskazano przypadki skutkujące przerwaniem finansowania lub zwrotu środków, przy czym brak efektu badawczego nie został w umowie o finansowanie wskazany jako sytuacja skutkująca koniecznością zwrotu otrzymanego dofinansowania. W szczególności, jeżeli w ramach realizacji Zadania Badawczego nie powstaną żadne prawa własności intelektualnej albo nie uda się ich skutecznie objąć ochroną prawną lub skomercjalizować - okoliczności te nie powodują obowiązku zwrotu dofinansowania wypłacanego na podstawie umowy o dofinansowanie. Również w przypadku uznania bezcelowości kontynuacji prac badawczych członkowie konsorcjum nie zwracają dotychczas uzyskanego i prawidłowo wydatkowanego finansowania. Na mocy umowy MNiSW nabędzie od wnioskodawcy wszelkie możliwe prawa do własności intelektualnej z chwilą złożenia przez wnioskodawcę oświadczenia o przeniesieniu na MNiSW własności intelektualnej, bez konieczności składania jakichkolwiek dodatkowych oświadczeń woli lub wiedzy. W przypadku gdy wnioskodawca nie złoży ww. oświadczenia MNiSW nabędzie własność intelektualną z chwilą zakończenia realizacji Zadania Badawczego, a jeśli to nie nastąpi przed rozwiązaniem umowy o finansowanie, z momentem rozwiązania umowy, bez konieczności składania jakichkolwiek dodatkowych oświadczeń woli lub wiedzy. Dalej we wniosku przedstawiono najważniejsze postanowienia regulaminu zarządzania i komercjalizacji Własności Intelektualnej, który określa w szczególności: a) prawa i obowiązki Instytutu P. w zakresie zarządzania, korzystania, ochrony i komercjalizacji własności intelektualnej; b) prawa i obowiązki członków Zespołu Badawczego, w zakresie ochrony i korzystania z własności intelektualnej oraz jej komercjalizacji; c) zasady oraz tryb nabywania przez Ministra własności intelektualnej, tryb podejmowania decyzji o komercjalizacji oraz decyzji o zabezpieczeniu i ochronie własności intelektualnej; d) zasady zabezpieczenia i ochrony własności intelektualnej; e) zasady i procedury komercjalizacji; f) zasady podziału środków z komercjalizacji; g) zasady i tryb ujawniania i upowszechniania wiedzy dotyczącej własności intelektualnej. Przytoczono również najważniejsze postanowienia umowy konsorcjum, z której m.in. wynika, że strony podejmują współpracę celem przeprowadzenia badań naukowych i prac rozwojowych w zakresie Zadania Badawczego, a jednostką naukową projektu jest wnioskodawca. Kolejno wskazano, że w związku z realizacją Zadania Badawczego wnioskodawca będzie ponosił następujące wydatki oraz nabywał następujące towary i usługi: 1) wynagrodzenia Zespołu Badawczego oraz personelu administracyjnego (w tym zarządzającego Zadaniem Badawczym), który zatrudniony jest przez Wnioskodawcę (na podstawie umowy o pracę lub umowy zlecenia); 2) tzw. koszty pośrednie wyliczone ryczałtem (na koszty pośrednie składają się m.in. koszty mediów doprowadzanych do laboratoriów, koszty wyposażenia biurowego i materiałów biurowych etc.); 3) koszty odpisów amortyzacyjnych od aparatury naukowo-badawczej i środków trwałych w zakresie niezbędnym i przez okres niezbędny do realizacji Zadania Badawczego; 4) koszty podwykonawstwa i usług obcych niezbędnych do prowadzenia działalności naukowej przez Zespół Badawczy bezpośrednio związanych z realizacją Zadania Badawczego; 5) materiały przeznaczone do bezpośredniego zużycia przy realizacji Zadania Badawczego, tj. surowce, półprodukty, odczynniki; 6) usługi związane z wyjazdami służbowymi, konferencje, konsultacje, szkolenia (koszty udziału w konferencjach i szkoleniach; 7) koszty usług transP.owych niezbędnych do prawidłowej realizacji prac badawczych, etc. Wszystkie wymienione wydatki ujęte zostały w kosztorysie Zadania Badawczego (w zadaniach przypisanych do wnioskodawcy) i są finansowane z dofinansowania objętego umową o finansowanie Zespołu Badawczego ze środków Funduszu. Faktury dokumentujące nabycia towarów i usług, dzięki którym realizowana jest część Zadania Badawczego przypisana do wnioskodawcy, wystawiane będą każdorazowo na wnioskodawcę. W związku z powyższym wnioskodawca sfomułował następujące pytania: 1) czy prawidłowe jest stanowisko wnioskodawcy, że otrzymywane ze środków Funduszu za pośrednictwem Instytutu P. - na podstawie umowy o finansowanie - środki finansowe (w części dystrybuowanej na rzecz wnioskodawcy) nie będą stanowiły podstawy opodatkowania podatkiem od towarów i usług, o której mowa w art. 29a ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. z 2025 r. poz. 775 ze zm.; dalej: ustawa o VAT); 2) czy prawidłowe jest stanowisko wnioskodawcy, że otrzymane - z tytułu podziału zysku z komercjalizacji zrealizowanej przez Instytut P. w imieniu MNiSW - środki finansowe będą stanowiły wynagrodzenie za realizację czynności opodatkowanych; 3) czy prawidłowe jest stanowisko wnioskodawcy, że podstawą opodatkowania VAT z tytułu realizacji czynności opodatkowanych - gdzie wynagrodzenie określone zostało jako podział zysku z komercjalizacji zrealizowanej przez Instytut P. w imieniu MNiSW - będzie wartość środków finansowych w części przypadającej na Wnioskodawcę (tj. część z 15% wysokości środków z komercjalizacji); 4) czy prawidłowe jest stanowisko wnioskodawcy, że przekazanie przez wnioskodawcę własności intelektualnej wyników Zadania Badawczego - w przypadku, gdy finalnie nie dojdzie do komercjalizacji - nie będzie stanowiło nieodpłatnego świadczenia podlegającego opodatkowaniu podatkiem VAT (tj. czynności, o której mowa w art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT). Prezentując własne stanowisko w sprawie co do pytania nr 1, wnioskodawca podał, że jego zdaniem otrzymywane ze środków Funduszu za pośrednictwem Instytutu P. - na podstawie umowy o dofinansowanie - środki finansowe (w części dystrybuowanej na rzecz wnioskodawcy) nie będą stanowiły podstawy opodatkowania podatkiem od towarów i usług, o której mowa w art. 29a ust. 1 ustawy o VAT, ani jako zapłata (wynagrodzenie) z tytułu sprzedaży, ani jako dopłata (finansowanie) mające bezpośredni wpływ na cenę usług świadczonych przez wnioskodawcę. Wnioskodawca podniósł, że otrzymywane finansowanie będzie pokrywało koszty, jakie ponosi wnioskodawca (a także pozostali członkowie konsorcjum) celem realizacji Zadania Badawczego. Nie można uznać, że między wnioskodawcą (a także pozostałymi członkami konsorcjum) a instytutem P. lub MNiSW zaistnieje związek prawny podobny do relacji usługodawcy-usługobiorcy, w ramach którego następuje wzajemne świadczenie. Ani Instytut P., ani MNiSW nie mieli/nie mają zapotrzebowania na konkretną usługę, gdzie szukaliby jej wykonawcy i gotowi byliby uiścić za jej nabycie stosowne wynagrodzenie. Konsorcjum (w tym wnioskodawca) nie zobowiąże się względem Instytutu P. lub MNiSW do realizacji na ich rzecz (któregokolwiek z pomiotów) określnego świadczenia. Konsorcjum (w tym wnioskodawca) zobowiąże się do realizacji (wg swojej najlepszej wiedzy i woli) Zadania Badawczego, jakie zostało zgłoszone w konkursie, czyli sprawdzenia pewnej określonej we wniosku konkursowym tezy badawczej. Konkurs nie określał i nie narzucał konkretnych zadań, tez jakie mają zostać zbadane w ramach Zadań Badawczych. Inicjatywa w tym zakresie należała będzie wyłącznie do konsorcjum, w którym występuje wnioskodawca. Dalej wnioskodawca podał, że wartość otrzymanych na podstawie umowy o dofinansowanie środków pieniężnych nie będzie stanowiła wartości faktycznie przekazanej w zamian za realizację usługi. Wnioskodawca zrealizuje własną tezę badawczą (a nie zleconą czynność). Od Instytutu P. (jako podmiotu zarządzającego) dostanie zaś środki na pokrycie kosztów tego badania (nazywanego Zadaniem Badawczym). Finansowanie nie będzie pozostawało w bezpośrednim związku z żadną czynnością, która miałaby być opodatkowana VAT. Wnioskodawca nie wycenia swoich świadczeń, nie kalkuluje w sposób nawet zbliżony do działań wolnorynkowych planowanych kosztów i przychodów z przedsięwzięcia. Będzie listował jedynie kwoty, jakie muszą zostać poniesione w związku z realizacją Zadania Badawczego (koszty wynagrodzeń, koszty mediów, nabycia towarów oraz usług wykorzystywanych do realizacji zadania, itp.). W ocenie wnioskodawcy Zadanie Badawcze nie będzie realizowane ani na rzecz Instytutu P., ani MNiSW. Za pośrednictwem Instytutu P. dystrybuowane będą jedynie środki publiczne przeznaczone na jego realizację. Nie ma w tym przypadku znaczenia, że wnioskodawca po realizacji Zadania Badawczego (w przypadku jego powodzenia) zobowiązany będzie doprowadzić do sytuacji, gdzie własność intelektualna wyników badań finalnie zostanie przeniesiona na rzecz MNiSW. Czynność ta (przeniesienie własności intelektualnej) będzie bowiem niezależna od faktu otrzymania dofinansowania na pokrycie kosztów realizacji Zadania Badawczego. Nie będzie konsekwencją otrzymanego dofinansowania. Stanowi element niezwiązany z samym dofinansowaniem. Nie będzie to czynność jaką można uznać za świadczenie wzajemne realizowane w zamian za otrzymane dofinansowanie. Przeniesienie własności intelektualnej do wyników Zadania Badawczego służy bowiem całkiem innym celom (i to odpłatnym). Przeniesienie praw do wyników Zadania Badawczego jest niezbędne do przeprowadzenia kolejnej czynności, tj. dokonania przez MNiSW (w imieniu którego działa Instytut P.) procesu komercjalizacji wyników badań. W wyniku zaś procesu komercjalizacji wnioskodawca (oraz pozostali członkowie konsorcjum) otrzyma od MNiSW wynagrodzenie należne w wysokości 15% środków uzyskanych z komercjalizacji (po potrąceniu kosztów jakie doprowadziły do tej komercjalizacji). Środki z komercjalizacji przysługują wnioskodawcy od MNiSW przez cały okres ich uzyskiwania (przez MNiSW). Tylko w tym celu - tj. aby uzyskać środki finansowe z finalnego efektu sprzedaży - wnioskodawca przenosi na MNiSW prawa własności intelektualnej do wyników Zadania Badawczego. Przeniesienie własności intelektualnej do wyników Zadania Badawczego następuje odpłatnie, ale nie w ramach finansowania Zadania Badawczego (czyli własnych prac wnioskodawcy), a w ramach wynagrodzenia jakie przysługuje wnioskodawcy z tytułu przyszłej komercjalizacji (jaka będzie miała miejsce, gdy Instytut P. obejmie wyniki badań ochroną prawną oraz kolejno dokona ich sprzedaży - w imieniu i na rzecz MNiSW). Zwrócono uwagę, że brak efektu badawczego nie został w umowie o finansowanie wskazany także jako sytuacja skutkująca koniecznością zwrotu otrzymanego dofinansowania. W szczególności, jeżeli w ramach realizacji Zadania Badawczego nie powstaną żadne prawa własności intelektualnej albo nie uda się ich skutecznie objąć ochroną prawną lub skomercjalizować - okoliczności te nie powodują obowiązku zwrotu dofinansowania wypłacanego na podstawie umowy o dofinansowanie. Również w przypadku uznania bezcelowości kontynuacji prac badawczych, członkowie konsorcjum nie zwracają dotychczas uzyskanego i prawidłowo wydatkowanego finansowania. Zdaniem wnioskodawcy stan faktyczny sprawy opisany we wniosku nie pozwala także na postawienie tezy, że otrzymane od MNiSW (za pośrednictwem Instytutu P.) finansowanie będzie posiadało cechy tzw. dotacji do ceny. Skoro nie zaistnieje świadczenie, które można uznać za odpłatną usługę - czy inaczej, w ogóle za usługę - wówczas nie zaistnieje także tzw. dopłata do ceny tego świadczenia. Aby zaistniała tzw. dopłata do ceny, musi zaistnieć obecny/przyszły bezpośredni nabywca świadczenia i realizowanego za odpłatnością. Musi być znany konkretny przedmiot transakcji, nabywca świadczenia jak i wysokość wynagrodzenia należnego, które dzięki dofinansowaniu jest bezpośrednio pomniejszane. Stan faktyczny analizowanej sprawy cech tych nie posiada. Odnosząc się do pytania nr 2, wnioskodawca stwierdził, że w jego ocenie otrzymane - z tytułu podziału zysku z komercjalizacji zrealizowanej przez Instytut P. w imieniu MNiSW - środki finansowe będą stanowiły wynagrodzenie za realizację czynności opodatkowanych VAT. Zdaniem strony uzyskiwane przez nią - określone Regulaminem komercjalizacji oraz umową o dofinansowanie - kwoty z tytułu udziału w korzyściach z komercjalizacji (czyli sprzedaży przez Instytut P. w imieniu i na rzecz MNiSW) praw do wyników Zadania Badawczego stanowić będą wynagrodzenie za świadczoną usługę, zdefiniowaną w art. 8 ust. 1 ustawy o VAT, ponieważ między wnioskodawcą a MNiSW istnieje związek prawny, w ramach którego będzie następowało świadczenie wzajemne - wynagrodzenie należne wnioskodawcy w zamian za możliwość objęcia ochroną prawną wyników Zadania Badawczego oraz korzystania przez MNiSW (celem komercjalizacji) z tych wyników. Wynagrodzenie otrzymane przez wnioskodawcę stanowić będzie wartość faktycznie przekazaną w zamian za usługę (tj. możliwość objęcia ochroną prawną wyników Zadania Badawczego oraz korzystania przez MNiSW celem komercjalizacji z tych wyników). Nadto będzie istniała bezpośrednia i jasno zindywidualizowana korzyść po stronie wnioskodawcy, a odpłatność za otrzymane świadczenie będzie pozostawała w bezpośrednim związku z czynnością, która będzie podlegała opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług -wysokość należności wypłacanej wnioskodawcy przez MNiSW będzie zależna od wielkości sprzedaży dokonanej przez MNiSW (jej rodzaju, częstotliwości). Nadto wartość świadczenia wzajemnego będzie wyrażona w pieniądzu. W kwestii pytania nr 3 wnioskodawca stwierdził, że podstawą opodatkowania VAT z tytułu realizacji czynności opodatkowanych - gdzie wynagrodzenie określone zostało jako podział zysku z komercjalizacji zrealizowanej przez Instytut P. w imieniu MNiSW - będzie wartość środków finansowych w części przypadającej na wnioskodawcę (tj. przypadająca na wnioskodawcę część z 15% środków z komercjalizacji). Wnioskodawca zauważył, że z umowy o dofinansowanie oraz regulaminu komercjalizacji jednoznacznie wynika, że wnioskodawcy - z tytułu sprzedaży zrealizowanej przez wnioskodawcę - przysługiwać będzie część z 15% środków uzyskanych z komercjalizacji zrealizowanej przez Instytut P. w imieniu MNiSW. Wartość ta stanowić będzie określone art. 29a ust. 1 ustawy o VAT "wszystko, co stanowi zapłatę, którą usługodawca ma otrzymać z tytułu sprzedaży od usługobiorcy lub osoby trzeciej. Odnosząc się do pytania nr 4, wnioskodawca stwierdził, że przekazanie przez niego własności intelektualnej (wyników Zadania Badawczego) - w przypadku, gdy finalnie nie dojdzie do komercjalizacji - nie będzie stanowiło nieodpłatnego świadczenia podlegającego opodatkowaniu VAT, tj. czynności, o której mowa w art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT. Wnioskodawca zauważył, że celem mechanizmu realizacji badań naukowych w ramach wirtualnego instytutu badawczego jest finalna komercjalizacja wyników Zadania Badawczego, tj. docelowa odpłatna sprzedaż praw do wyników badań. Zdarzyć się jednakże może, że Instytut P. uzna, iż z uwagi na obiektywne przesłanki, przekazana przez wnioskodawcę własność intelektualna nie zostanie objęta ochroną prawną (z uwagi np. na zbyt niski potencjał komercjalizacyjny) lub też, mimo najlepszych działań Instytutu P., z przyczyn obiektywnych do finalnej sprzedaży praw nie dojdzie (np. nie znajdzie się chętny aby je nabyć). Wówczas okaże się, że - z przyczyn obiektywnych - świadczenie wnioskodawcy (post factum) zostało zrealizowane nieodpłatnie. Zdaniem wnioskodawcy wówczas nie można uznać, że w ogóle zastosowanie znajdzie hipoteza art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT. Przepis ten znajduje bowiem zastosowanie w sytuacji, gdy czynność od samego początku - z zamiaru wnioskodawcy - ma charakter nieodpłatny. W ww. przypadku sytuacja taka nie ma miejsca. Celem wnioskodawcy jest uzyskanie wynagrodzenia z tytułu zbycia - z założenia - odpłatnego własności intelektualnej (w wysokości 15% środków z komercjalizacji po potrąceniu jej kosztów przez Instytut P.). Jednakże, z ostrożności, nawet przyjmując stanowisko odmienne (że aktywuje się w takiej sytuacji hipoteza art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT), nie będziemy mieli do czynienia z czynnością opodatkowaną VAT. Wykładnia art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT nakazuje bowiem ustalić, w jakim celu dokonane zostaje nieodpłatne przekazanie świadczeń (tutaj usług). Jeżeli w celu niezwiązanym z działalnością wnioskodawcy, wówczas mamy do czynienia z działalnością opodatkowaną VAT. Jako cel niezwiązany z działalnością wnioskodawcy należy uznać cel, z którego korzyści odnosi jedynie podmiot trzeci (uzyskujący prawa), a wnioskodawca nie ma z tego tytułu żadnej wartości dodanej. Podmiot trzeci zamiast nabyć odpłatnie usługę otrzymuje ją w swoim "prywatnym" celu nieodpłatnie. W stanie faktycznym sprawy przedstawionej we wniosku takiej tezy postawić nie można. Wnioskodawca po realizacji Zadania Badawczego (w przypadku jego powodzenia) przeniesie własność intelektualną wyników badań. W wyniku zaś procesu komercjalizacji wnioskodawca (oraz pozostali członkowie konsorcjum) ma otrzymać od MNiSW wynagrodzenie. Tylko w tym celu, tj. aby uzyskać wynagrodzenie z finalnego efektu sprzedaży wyników badań, wnioskodawca będzie przenosił własność intelektualną do wyników Zadania Badawczego. Będzie to jedynie środek prowadzący do dalszego celu pozwalający na finalne uzyskanie przez wnioskodawcę wynagrodzenia z tytułu komercjalizacji. Będzie to więc czynność ściśle związana z działalnością wnioskodawcy (zrealizowana celem uzyskania przyszłych zysków z tytułu realizacji czynności opodatkowanych VAT). Dlatego w przypadku zaistnienia obiektywnych przeszkód, jakie uniemożliwią wskazaną komercjalizację (de facto niezależnych od wnioskodawcy), nie zostanie wypełniona dyspozycja art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT. Organ, oceniając zaprezentowane stanowisko wnioskodawcy, stwierdził, że jest ono prawidłowe w zakresie uznania środków z tytułu podziału zysku z komercjalizacji zrealizowanej przez Instytut P. za wynagrodzenie za realizację czynności opodatkowanych (pytanie nr 2) oraz co do uznania środków finansowych w części przypadającej na wnioskodawcę (tj. części z 15% wartości środków finansowych uzyskanych z komercjalizacji) za podstawę opodatkowania z tytułu realizacji czynności opodatkowanych (pytanie nr 3). Organ uznał zaś stanowisko wnioskodawcy za nieprawidłowe w zakresie nieuznania za podstawę opodatkowania środków finansowych - w części dystrybuowanej na rzecz wnioskodawcy - otrzymywanych ze środków Funduszu za pośrednictwem Instytutu P. (pytanie nr 1) oraz co do braku uznania przekazania przez wnioskodawcę własności intelektualnej wyników Zadania Badawczego - w przypadku, gdy finalnie nie dojdzie do komercjalizacji - za nieodpłatne świadczenie podlegające opodatkowaniu podatkiem VAT zgodnie z art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT (pytanie nr 4). Uzasadniając swoje stanowisko, DKIS przywołał art. 5 ust. 1 pkt 1, art. 7 ust. 1, art. 8 ust. 1 i ust. 2, art. 15 ust. 1 i ust. 2 oraz art. 29a ust. 1, ust. 6 i ust. 7 ustawy o VAT. DKIS wskazał, że z powyższych przepisów wynika, że, co do zasady, podstawa opodatkowania obejmuje wszystko, co stanowi wartość otrzymanego świadczenia, które dostawca lub świadczący usługę otrzymuje lub powinien otrzymać od kupującego. Przepis art. 29a ust. 6 i ust. 7 ustawy o VAT wymienia elementy, które powinny być wliczane bądź nie powinny być wliczane do podstawy opodatkowania. Do podstawy opodatkowania podatkiem od towarów i usług wlicza się tylko takie dotacje, subwencje i inne dopłaty o podobnym charakterze, które mają bezpośredni wpływ na kwotę należną (cenę) z tytułu dostawy towaru lub świadczenia usługi. Nie jest więc podstawą opodatkowania ogólna dotacja (subwencja, inna dopłata o podobnym charakterze) uzyskana przez podatnika, niezwiązana z dostawą towaru lub świadczeniem usługi. W przypadku natomiast, gdy podatnik otrzyma dofinansowanie, które będzie związane z dostawą lub świadczeniem usług, jako pokrycie części ceny konkretnego świadczenia lub rekompensatę z tytułu wykonania określonego świadczenia po cenach obniżonych, płatność taka będzie zaliczana do podstawy opodatkowania podatkiem od towarów i usług. Odwołując się do orzecznictwa Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej, organ wskazał, że pojęcie subwencji (dotacji) bezpośrednio związanych z ceną należy interpretować jako obejmujące wyłącznie subwencje, które stanowią całość lub część wynagrodzenia za dostawę towarów lub świadczenie usług, a które są wypłacane przez podmiot trzeci w stosunku do sprzedawcy lub świadczącego. W celu ustalenia, czy dotacja stanowi wynagrodzenie, cena towarów i usług musi, co do zasady, być ustalana nie później, niż w momencie zdarzenia podlegającego opodatkowaniu. Zobowiązanie do zapłaty dotacji dokonane przez osobę, która jej udziela, rodzi korelat, jakim jest prawo beneficjenta do jej otrzymania, ponieważ dokonał on dostawy podlegającej opodatkowaniu. Ten związek pomiędzy dotacją a ceną musi być jednoznacznie widoczny na podstawie indywidualnej analizy okoliczności stanowiących podstawę wypłaty tego wynagrodzenia. Z drugiej strony nie jest konieczne, aby cena towarów lub usług bądź część tej ceny została ustalona. Wystarczy, by możliwe było jej ustalenie. Cena jaką płaci nabywca musi być ustalana w taki sposób, że zmniejsza się ona w proporcji do dotacji przyznanej sprzedawcy towarów lub świadczącemu usługi, co zatem stanowi element ustalenia ceny, jakiej żąda ten ostatni. Zatem, jeżeli otrzymywane dofinansowanie (dotacja) jest w sposób zindywidualizowany i policzalny związane z ceną danego świadczenia (tj. świadczenie dzięki dotacji ma cenę niższą o konkretną kwotę), takie dofinansowanie podlega opodatkowaniu VAT. Jeżeli natomiast związek tego rodzaju nie występuje i równocześnie dofinansowanie nie jest elementem wynagrodzenia związanego z danymi dostawami towarów lub usług, wówczas można - i należy - potraktować je jako płatność niepodlegającą VAT. Zdaniem DKIS w analizowanej sprawie mamy do czynienia z sytuacją, w której wystąpią skonkretyzowane świadczenia w zamian za określone wynagrodzenie. Środki finansowe, które wnioskodawca otrzyma ze środków Funduszu za pośrednictwem Instytutu P. na realizację Zadania Badawczego należy uznać za otrzymane od osoby trzeciej środki (dotacje, subwencje lub dopłaty o podobnym charakterze) mające bezpośredni wpływ na cenę świadczonych przez stronę usług. DKIS wskazał, że ostatecznym beneficjentem czynności wykonywanych przez wnioskodawcę w związku z realizacją projektu będzie Skarb Państwa - MNISW. Fakt, że strona nie będzie pobierać odpłatności od ostatecznego beneficjenta za wykonanie określonych czynności w ramach projektu, nie oznacza, że ww. świadczenia wykonane zostaną nieodpłatnie. W tej sytuacji zapłatą za te świadczenia będą środki finansowe otrzymane od Instytutu P., nazwane we wniosku dofinansowaniem. Tym samym, realizację Zadania Badawczego określonego w projekcie należy uznać za podlegające opodatkowaniu świadczenie usług. W przedmiotowej sprawie zostaną bowiem spełnione wszystkie przesłanki, aby uznać wykonywane przez stronę w ramach projektu czynności za świadczenie usług w rozumieniu art. 8 ust. 1 ustawy o VAT, podlegające opodatkowaniu VAT na podstawie art. 5 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT. W analizowanym przypadku będzie istniał bezpośredni związek pomiędzy dokonanym świadczeniem, polegającym na realizacji Zadania Badawczego, w ramach którego zostanie wytworzona własność intelektualna, a otrzymanym w zamian od osoby trzeciej wynagrodzeniem. Zdaniem DKIS istotne jest, że dofinansowanie zostanie przyznane w związku z konkretnym świadczeniem (Zadaniem Badawczym), a nie na ogólną działalność wnioskodawcy. A zatem przedmiotowe dofinansowanie będzie miało związek z ceną świadczonych usług, gdyż bezpośrednio będzie wpływało na cenę świadczenia (beneficjent nie będzie wnosił opłaty za własność intelektualną, którą otrzyma w wyniku realizacji projektu), zatem będzie zwiększało podstawę opodatkowania, o której mowa w art. 29a ust. 1 ustawy o VAT, a tym samym będzie podlegało opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, zgodnie z art. 5 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT. DKIS wspomniał, że wnioskodawca zaproponował Instytutowi P. wykonanie określonej usługi, a Instytut P. przyjmie ofertę i zobowiąże się do zapłaty wynagrodzenia w wysokości poniesionych przez stronę kosztów oraz części kwot uzyskanych ze sprzedaży rezultatów projektu. Przy czym należy mieć na uwadze, że w analizowanej sprawie strona będzie zobowiązana, aby przenieść wytworzoną w ramach Zadania Badawczego całość własności intelektualnej na MNiSW. Zatem zarówno dofinansowanie, przeznaczone na realizację Zadania Badawczego i przekazanie własności intelektualnej na rzecz MNiSW, jak i wpływy z komercjalizacji własności intelektualnej wytworzonej w wyniku realizacji Zadania Badawczego, będą stanowiły wynagrodzenie za usługę świadczoną przez wnioskodawcę na rzecz Instytutu P. W analizowanej sprawie nie można rozpatrywać odrębnie procesu realizacji Zadania Badawczego i wytworzonej w jego wyniku własności intelektualnej. Nie można się zgodzić z wnioskodawcą, że przeniesienie własności intelektualnej na MNiSW nie jest konsekwencją otrzymanego dofinansowania. MNiSW nabędzie własność intelektualną wytworzoną w wyniku realizacji Zadania Badawczego niezależnie od tego, czy strona złoży oświadczenie wymagane umową o finansowanie, czy nie. Oznacza to, że przeniesienie własności intelektualnej na MNiSW będzie konsekwencją otrzymanego dofinansowania. Jak wskazano powyżej, strona otrzyma dofinansowanie na ściśle określone Zadanie Badawcze, a jednym ze świadczeń, jakie ma zrealizować w ramach realizacji umowy o finansowanie, będzie przeniesienie na MNiSW własności intelektualnej. W analizowanym przypadku będzie istniał bezpośredni związek pomiędzy dokonanym świadczeniem (realizacją Zadania Badawczego) a otrzymanym od osoby trzeciej wynagrodzeniem w zamian za przeniesienie powstałej jako efekt realizacji Zadania Badawczego własności intelektualnej. Tym samym otrzymane przez wnioskodawcę dofinansowanie oraz środki z komercjalizacji stanowić będą wynagrodzenie za usługę, podlegającą opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, na podstawie art. 5 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT. W zakresie pytania nr 4 DKIS ocenił, że stanowisko strony było nieprawidłowe, wskazując, że nieodpłatne świadczenie usług - co do zasady - nie podlega opodatkowaniu VAT, z wyjątkiem ściśle określonych sytuacji, wskazanych m.in. w art. 8 ust. 2 ustawy o VAT. Wynika z niego, że aby nieodpłatne świadczenie usług podlegało opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, muszą być spełnione określone warunki: - w przypadku użycia towarów stanowiących część przedsiębiorstwa - użycie ich do celów innych niż działalność gospodarcza podatnika oraz istnienie prawa do odliczenia w całości lub w części podatku naliczonego m.in. przy nabyciu tych towarów (warunki te muszą być spełnione łącznie), - w przypadku świadczenia usług - świadczenie ich do celów innych niż działalność gospodarcza podatnika. Dalej DKIS podał, że jednym z założeń projektu jest przekazanie wartości intelektualnej, wytworzonej w ramach realizacji Zadania Badawczego, na rzecz MNiSW w celu komercjalizacji, tj. sprzedaży praw do własności intelektualnej za pośrednictwem Instytutu P. i przekazania części uzyskanych środków na rzecz wnioskodawcy. Przekazanie praw do wyników działalności naukowej (w tym know-how) na rzecz Instytutu P. (a docelowo – na rzecz MNiSW) i planowana komercjalizacja będą nierozerwalnie związane z procesem wytworzenia wartości intelektualnej w ramach realizacji Zadania Badawczego. Do przekazania praw i komercjalizacji dojdzie tylko wtedy, jeśli własność intelektualna zostanie wytworzona. Jeżeli Instytut P. nie sprzeda praw do własności intelektualnej wytworzonej w projekcie i w konsekwencji strona nie otrzyma swojej części wpływów z komercjalizacji, nie będzie to oznaczało, że świadczenie na rzecz Instytutu P. - przekazanie praw do własności intelektualnej -będzie świadczeniem nieodpłatnym, gdyż zapłatą za to świadczenie będą otrzymane przez wnioskodawcę środki w ramach finansowania Zadania Badawczego. W analizowanej sprawie nie znajdzie zatem zastosowania art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT, gdyż świadczenie realizowane na rzecz Instytutu P. będzie odpłatne nawet pomimo braku komercjalizacji. Nie godząc się z przytoczoną interpretacją indywidualną, strona wniosła skargę do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego we Wrocławiu. Zaskarżonej interpretacji zarzucono: 1) naruszenie przepisów postępowania, tj. art. 14c § 1 i § 2 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2026 r. poz. 622; dalej: Ordynacja podatkowa, o.p.), poprzez niewłaściwe uzasadnienie prawne zaskarżonej interpretacji polegające na zajęciu stanowiska w oderwaniu od przedstawionego przez Stronę stanu faktycznego, tj. bez uwzględnienia specyfiki konstrukcji jaką wprowadzono w badaniach realizowanych w ramach tzw. wirtualnego instytutu badawczego, gdzie pierwotnie Strona realizuje badanie, którego koszty są finansowane ze środków Funduszu, a dopiero kolejno - po zakończeniu Zadania Badawczego - dokonuje czynności opodatkowanej podatkiem od towarów i usług, tj. sprzedaży praw własności intelektualnej; 2) naruszenie przepisów postępowania, tj. art. 14c § 1 i § 2 Ordynacji podatkowej, poprzez niewłaściwe uzasadnienie prawne zaskarżonej interpretacji polegające na istnieniu wewnętrznej rozbieżności w treści tego uzasadnienia skutkującej brakiem możliwości jednoznacznego wywnioskowania podstawę opodatkowania jakiej czynności - zdaniem organu - stanowią środki otrzymywane z Funduszu, którymi strona finansuje koszty realizowanego Zadania Badawczego (środki przypadające na rzecz strony z tytułu realizowanych przez stronę w Zadaniu Badawczym czynności); 3) niewłaściwą ocenę co do zastosowania przepisu prawa materialnego, tj. art. 29a ust. 1 ustawy o VAT polegającą na przyjęciu, że przepis ten ma zastosowanie do środków finansowych otrzymywanych przez stronę ze środków Funduszu celem pokrycia wydatków związanych z realizacją Zadania Badawczego, a w rezultacie przyjęcie, że środki te stanowią podstawę opodatkowania po stronie wnioskodawcy, z tytułu realizowanej w przyszłości sprzedaży praw własności intelektualnej; 4) niewłaściwą ocenę co do niezastosowania przepisu prawa materialnego, tj. art. 8 ust. 2 pkt 2 w zw. z art. 29a ust. 1 ustawy o VAT polegającą na przyjęciu, że w analizowanej sprawie w ogóle nie znajdzie zastosowania art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT, gdyż świadczenie realizowane na rzecz MNiSW będzie odpłatne nawet pomimo braku komercjalizacji. W uzasadnieniu skargi podniesiono w szczególności, że uzasadnienie zaskarżonej interpretacji zawiera pewne rozbieżności, które nie pozwalają w pełni odkodować, co stanowiło podstawę interpretacji indywidualnej. Istnienie tej rozbieżności nie pozwala bowiem jednoznacznie i bezspornie stwierdzić, czy zdaniem organu podatkowego, w przedstawionym przez stronę stanie faktycznym sprawy istnieje tak naprawdę jedna czy też dwie odrębne następujące po sobie czynności opodatkowane podatkiem od towarów i usług. Trudno także wywnioskować, czy zdaniem organu podatkowego, otrzymane od Instytutu P. finansowanie stanowi wynagrodzenie za usługę (realizowaną na rzecz MNiSW) uiszczane ze środków Funduszu, czy też jest to forma dotacji do ceny tej usługi. Zdaniem strony w warunkach niniejszej sprawy o bezpośrednim związku z ceną moglibyśmy mówić, gdyby Skarb Państwa (w imieniu którego występuje MNiSW) nabywał konkretną usługę, tj. wyniki badań prowadzone przez stronę, po określonej cenie lub płacił określoną cenę za samo prowadzenie tychże badań, a cena za usługę zależałaby od uzyskanej kwoty dofinansowania. W takim przypadku świadczenie strony powinno zostać jednak wycenione (znana winna być cena usługi), a kwota wynagrodzenia za świadczenie powinna być odpowiednio zmniejszona, przy czym to zmniejszenie powinno odpowiadać kwocie otrzymanego dofinansowania. Przede wszystkim jednak, aby twierdzić, że dofinansowanie jest dopłatą do ceny za świadczenie usługi musielibyśmy mieć do czynienia z usługą realizowaną przez stronę. W analizowanym stanie faktycznym strona nie świadczy żadnej usługi, której cena ulegałaby jakiejkolwiek modyfikacji wskutek otrzymanego dofinansowania. Przekazanie dofinansowania, a realizacja Zadania Badawczego i przeniesienie praw własności intelektualnej to dwa niezależne świadczenia, które nie mają ekwiwalentnego charakteru i które służą dwóm różnym celom. Otrzymywane finansowanie ma za zadanie sfinansować prace rozwoje i badania w ramach projektu, nie jest to natomiast zapłatą za zleconą usługę. Strona podkreśliła, że w we wniosku o interpretację wyraźnie wskazano, że przeniesienie praw własności intelektualnej do powstałych wyników badań będzie odpłatne tylko w przypadku, gdy dojdzie do komercjalizacji tych wyników. W przypadku, gdy uda się zrealizować Zadanie Badawcze, a prawa własności intelektualnej do wyników powstałych w toku jego realizacji zostaną skomercjalizowane, strona otrzyma wynagrodzenie w wysokości 15% przychodów uzyskanych z tej komercjalizacji. Gdy do komercjalizacji nie dojdzie, świadczenie strony pozostanie nieodpłatne. Wysokość wynagrodzenia uzyskanego przez stronę z komercjalizacji będzie przy tym znana dopiero, gdy dojdzie do komercjalizacji. Nie jest ona znana na etapie zawarcia umowy o dofinansowanie (znany jest jedynie procent/udział strony w przychodach z komercjalizacji). Wysokość dofinansowania nie jest więc w żaden sposób zależna od potencjalnej komercjalizacji wyników badań i wysokości uzyskanego w przyszłości dofinansowania. Wynagrodzenie nie było również kalkulowane w oparciu o potencjalny przychód z komercjalizacji, ponieważ taki przychód nie był znany w dacie zawarcia umowy o finansowanie. Mając na uwadze to, że strona nie będzie świadczyła żadnej usługi w ramach umowy o dofinansowanie i nie będzie kalkulowała ceny realizowanych przez siebie świadczeń, która miałaby ulegać zmianie wskutek otrzymania dofinansowania, nie sposób uznać, że dofinansowanie ma charakter cenotwórczy i stanowi przedmiot opodatkowania na podstawie art. 29a ustawy o VAT. Tymczasem DKIS przyjął nieprawidłowe założenie, że realizacja Zadania Badawczego i następujące po tej realizacji przekazanie praw do wyników działalności naukowej celem dokonania przyszłej ewentualnej komercjalizacji stanowią jedną czynność (świadczenie), które jest ze sobą nierozerwalnie związane. Konsekwencją tego założenia jest uznanie, że środki otrzymane celem pokrycia wydatków związanych z realizacją Zadania Badawczego oraz środki z komercjalizacji stanowić będą (łącznie) wynagrodzenie za usługę. Strona skarżąca wniosła o uchylenie zaskarżonej interpretacji oraz zasądzenie na jej rzecz kosztów postępowania według norm przepisanych. W odpowiedzi na skargę DKIS wniósł o oddalenie skargi, podtrzymując stanowisko wyrażone w zaskarżonej interpretacji indywidualnej. Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu zważył, co następuje: Zgodnie z art. 134 § 1 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. - Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz.U. z 2026 r. poz. 143 ze zm.; dalej: p.p.s.a.), sąd rozstrzyga w granicach danej sprawy nie będąc jednak związany zarzutami i wnioskami skargi oraz powołaną podstawą prawną, z zastrzeżeniem art. 57a. W myśl art. 57a p.p.s.a. skarga na pisemną interpretację przepisów prawa podatkowego wydaną w indywidualnej sprawie może być oparta wyłącznie na zarzucie naruszenia przepisów postępowania, dopuszczeniu się błędu wykładni lub niewłaściwej oceny co do zastosowania przepisu prawa materialnego. Sąd administracyjny jest związany zarzutami skargi oraz powołaną podstawą prawną. Stosownie do treści art. 146 § 1 p.p.s.a., sąd, uwzględniając skargę na interpretację indywidualną, uchyla tę interpretację. Przepis art. 145 § 1 pkt 1 p.p.s.a. stosuje się odpowiednio. Odpowiednie stosowanie art. 145 § 1 pkt 1 p.p.s.a. prowadzi do wniosku, że sąd uchyla interpretację w całości albo w części jeżeli stwierdzi: 1) naruszenie prawa materialnego, które miało wpływ na wynik sprawy; 2) naruszenie prawa dające podstawę do wznowienia postępowania administracyjnego lub 3) inne naruszenie przepisów postępowania, jeżeli mogło ono mieć istotny wpływ na wynik sprawy. Natomiast w razie nieuwzględnienia skargi w całości albo w części sąd oddala skargę odpowiednio w całości albo w części (art. 151 p.p.s.a.). Przechodząc do omówienia motywów rozstrzygnięcia, należy zauważyć, że zasadniczym przedmiotem sporu strony skarżącej z organem pozostaje kwestia, czy przekazane w ramach dofinansowania z Funduszu środki przeznaczone na realizację Zadania Badawczego należy uznać za dotację mającą bezpośredni wpływ na cenę usług świadczonych przez skarżącą, powiększającą postawę opodatkowania zgodnie z art. 29a ust. 1 ustawy o VAT. Zauważenia wobec tego wymaga, że zbliżony problem prawny, tj. kwalifikacji prawnopodatkowej dofinansowania zadań badawczych przez inny podmiot (Narodowe Centrum Badań i Rozwoju oraz Instytut P.), był już przedmiotem wypowiedzi sądów administracyjnych. W tym zakresie ukształtowana została linia orzecznicza kwestionująca stanowisko wyrażane przez DKIS w interpretacjach indywidualnych (zob. m.in.: wyrok NSA z 18 listopada 2025 r., I FSK 814/22; wyrok NSA z 19 maja 2025 r., I FSK 2063/24; wyrok NSA z 3 kwietnia 2024 r., I FSK 1836/21; wyrok NSA z 14 czerwca 2023 r., I FSK 326/19; wyrok NSA z 18 kwietnia 2023 r., I FSK 466/20; wyrok NSA z 31 stycznia 2023 r., I FSK 2058/19; wyrok NSA z 25 stycznia 2023 r., I FSK 1478/19; wyrok NSA z 21 grudnia 2022 r., I FSK 1346/19; wyrok NSA z 16 maja 2022 r., I FSK 274/19; wyrok NSA z 7 października 2021 r., I FSK 217/21; wyrok NSA z 21 marca 2019 r., I FSK 1363/18, a także np. wyrok WSA w Olsztynie z 4 września 2024 r., I SA/Ol 200/24; wyrok WSA w Krakowie z 29 sierpnia 2024 r., I SA/Kr 451/24; wyrok WSA w Warszawie z 16 listopada 2023 r., III SA/Wa 1597/23 – orzeczenia sądów administracyjnych są dostępne w Centralnej Bazie Orzeczeń Sądów Administracyjnych: orzeczenia.nsa.gov.pl). Sąd w składzie rozpoznającym niniejszą sprawę stanowisko wyrażone w tych orzeczeniach podzielił i przyjął prezentowaną w nich argumentację jako własną. Idąc dalej, należy wskazać, że na podstawie art. 5 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT, opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług podlegają odpłatna dostawa towarów i odpłatne świadczenie usług na terytorium kraju. Stosownie do art. 8 ust. 1 ustawy o VAT przez świadczenie usług, o którym mowa w art. 5 ust. 1 pkt 1, rozumie się każde świadczenie na rzecz osoby fizycznej, osoby prawnej lub jednostki organizacyjnej niemającej osobowości prawnej, które nie stanowi dostawy towarów w rozumieniu art. 7, w tym również: 1) przeniesienie praw do wartości niematerialnych i prawnych, bez względu na formę, w jakiej dokonano czynności prawnej; 2) zobowiązanie do powstrzymania się od dokonania czynności lub do tolerowania czynności lub sytuacji; 3) świadczenie usług zgodnie z nakazem organu władzy publicznej lub podmiotu działającego w jego imieniu lub nakazem wynikającym z mocy prawa. Natomiast, zgodnie z art. 29a ust. 1 ustawy o VAT, podstawą opodatkowania, z zastrzeżeniem ust. 2, 3 i 5, art. 30a-30c, art. 32, art. 119 oraz art. 120 ust. 4 i 5, jest wszystko, co stanowi zapłatę, którą dokonujący dostawy towarów lub usługodawca otrzymał lub ma otrzymać z tytułu sprzedaży od nabywcy, usługobiorcy lub osoby trzeciej, włącznie z otrzymanymi dotacjami, subwencjami i innymi dopłatami o podobnym charakterze mającymi bezpośredni wpływ na cenę towarów dostarczanych lub usług świadczonych przez podatnika. Przepis ten stanowi implementację art. 73 dyrektywy Rady 2006/112/WE z dnia 28 listopada 2006 r. w sprawie wspólnego systemu podatku od wartości dodanej (Dz.Urz. UE z 11 grudnia 2006 r. Nr L 347, s. 1 ze zm.; dalej: dyrektywa VAT), zgodnie z którym w odniesieniu do dostaw towarów i świadczenia usług innych niż te, o których mowa w art. 74-77, podstawa opodatkowania obejmuje wszystko, co stanowi zapłatę otrzymaną lub którą dostawca lub usługodawca otrzyma w zamian za dostawę towarów lub świadczenie usług, od nabywcy, usługobiorcy lub osoby trzeciej, włącznie z subwencjami związanymi bezpośrednio z ceną takiej dostawy lub świadczenia. Z treści art. 29a ust. 1 ustawy o VAT wynika, że do podstawy opodatkowania podatkiem od towarów i usług wlicza się tylko takie dotacje, subwencje i inne dopłaty o podobnym charakterze, które mają bezpośredni wpływ na kwotę należną (cenę) z tytułu dostawy lub świadczenia usługi. Elementem zasadniczym wpływającym na objęcie uzyskiwanej przez podatnika dotacji definicją podstawy opodatkowania jest stwierdzenie, że dotacja udzielana jest w celu sfinansowania, czy też dofinansowania, dostawy konkretnych towarów lub świadczenia konkretnych usług. Oznacza to, że podstawa opodatkowania obejmuje dotacje o charakterze przedmiotowym, a nie te, które mają charakter podmiotowy. Z orzecznictwa Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej wynika, że do podstawy opodatkowania VAT zalicza się, w przypadkach które określa art. 73 dyrektywy VAT, m.in. przyznane podatnikom subwencje bezpośrednio związane z ceną dostawy lub świadczenia. Przepis ten zmierza do obciążenia podatkiem od towarów i usług całej wartości towarów lub usług, a przez to do uniknięcia zmniejszenia przychodu z podatku na skutek przyznania subwencji. W rozpatrywanej sprawie DKIS przyjął, że dofinansowanie uzyskiwane przez skarżącą na realizację Zadania Badawczego powinno zwiększać podstawę opodatkowania, gdyż wpływa na ostateczną cenę świadczenia. Organ uznał, że istnieje bezpośredni związek pomiędzy dokonanym świadczeniem, polegającym na realizacji Zadania Badawczego, w ramach którego zostanie wytworzona własność intelektualna, a otrzymanym dofinansowaniem. Zdaniem organu dofinansowanie ma związek z ceną świadczonych usług, gdyż bezpośrednio wpływa na cenę świadczenia, wobec czego zwiększa podstawę opodatkowania, o której mowa w art. 29a ust. 1 ustawy o VAT, a tym samym podlega opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, zgodnie z art. 5 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT (str. 40 zaskarżonej interpretacji). Swoje stanowisko w tym zakresie DKIS wywodził z uznania, że opisana we wniosku chronologia podejmowanych czynności oraz sekwencje opisanych zdarzeń prowadzą do konkluzji, że mamy do czynienia z jednym świadczeniem podlegającym opodatkowaniu VAT. Organ wskazywał (str. 41-42 zaskarżonej interpretacji), że w ramach opisanych umów, mamy do czynienia z następującą sekwencją zdarzeń: 1) ogłoszenie konkursu; 2) przedstawienie Zadania Badawczego i określenie ceny za jego realizację ustalonej na poziomie poniesionych kosztów; 3) otrzymanie dofinansowania z Funduszu; 4) realizacja Zadania Badawczego, w ramach którego powstanie własność intelektualna; 5) przekazanie praw własności intelektualnej na rzecz Skarbu Państwa (MNISW); 6) komercjalizacja wyników badań; 7) partycypowanie wnioskodawcy w podziale wynagrodzenia uzyskanego przez Instytut P. W ocenie DKIS w tak zidentyfikowanym schemacie dofinasowanie z Funduszu jest przekazywane w celu sfinansowania konkretnej czynności podlegającej opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług (przekazania praw własności intelektualnej wytworzonych w ramach Zadania Badawczego). W analizowanym przypadku, w ocenie organu, istnieje bezpośredni związek pomiędzy dokonanym świadczeniem, polegającym na realizacji Zadania Badawczego, w ramach którego zostanie wytworzona własność intelektualna, a otrzymanym w zamian wynagrodzeniem. Biorąc pod uwagę, że planowana jest komercjalizacja wytworzonej w ramach Zadania Badawczego własności intelektualnej, DKIS uznał, że beneficjent świadczenia realizowanego przez wnioskodawcę uzyska korzyść o charakterze majątkowym, tj. otrzyma prawo własności intelektualnej wytworzonej w ramach Zadania Badawczego. W konsekwencji organ przyjął, że środki finansowe, które otrzymuje wnioskodawca ze środków Funduszu na realizację Zadania Badawczego należy uznać za otrzymane od osoby trzeciej środki (dotacje, subwencje lub dopłaty o podobnym charakterze), mające bezpośredni wpływ na cenę świadczonych przez Wnioskodawcę usług, a tym samym stanowiące podstawę opodatkowania w rozumieniu art. 29a ust. 1 ustawy o VAT. Oceniając prawidłowość rozumowania organu, Sąd wskazuje, że w tym zakresie orzecznictwo TSUE zwraca uwagę na konieczność istnienia bezpośredniego związku pomiędzy dotacją a świadczeniem usług lub dostawą towarów. Przykładowo w wyroku TSUE z 15 lipca 2004 r., Komisja przeciwko Niemcom, C-144/02, EU:C:2004:444 (wydanym na gruncie poprzednio obowiązującej dyrektywy dotyczącej VAT, ale zachowującym aktualność), wskazano, że subwencja powinna przede wszystkim być przyznawana konkretnie podmiotowi subwencjonowanemu po to, by dostarczał on określonego towaru lub wykonywał określoną usługę. Jedynie w tym przypadku subwencja może być uznana za świadczenie wzajemne względem dostawy towaru lub świadczonej usługi, a w związku z tym podlegać opodatkowaniu (pkt 28). Ponadto należy zbadać, czy nabywcy towarów lub usługobiorcy czerpią zysk z subwencji przyznanej jej beneficjentowi. Należy zatem zbadać, czy okoliczność, że subwencja jest przyznawana sprzedawcy lub świadczącemu usługi, pozwala mu obiektywnie na sprzedaż towarów lub świadczenie usług po cenie niższej od tej, której by żądał, gdyby nie otrzymał subwencji (pkt 29). Powinno być w każdym razie możliwe zidentyfikowanie świadczenia wzajemnego, które stanowi subwencja. Nie ma konieczności, by kwota subwencji odpowiadała dokładnie zmniejszeniu ceny dostarczonego towaru lub wykonanej usługi. Wystarczy, by korelacja istniejąca między tym zmniejszeniem a wspomnianą wyżej subwencją, która może mieć charakter ryczałtowy, była istotna (pkt 30). Podobne stanowisko TSUE zawarł również w wyroku z 22 listopada 2001 r., Office des produits wallons, C-184/00, EU:C:2001:629C-184/00, gdzie wskazano, że subwencje związane bezpośrednio z ceną interpretuje się jako obejmujące jedynie subwencje, które stanowią całość lub część wzajemnego świadczenia za dostawę towarów lub usług i które są płacone przez stronę trzecią sprzedawcy lub dostawcy (pkt 18). Stanowisko takie prezentowane jest również w nowszym orzecznictwie, przykładowo w wyroku z 9 października 2019 r., C (VAT i subwencje rolne), C-573/18, EU:C:2019:847. W świetle powyższego, kryterium decydującym o uznaniu dotacji za stanowiącą podstawę opodatkowania jest zatem stwierdzenie, czy dotacja dokonywana jest w celu sfinansowania konkretnej czynności podlegającej opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług. Dotacje niedające się powiązać z konkretnymi czynnościami podlegającymi opodatkowaniu VAT nie stanowią podstawy opodatkowania w rozumieniu art. 29a ust. 1 ustawy o VAT. Nie ma przy tym znaczenia od kogo dostawca towaru lub świadczący usługę otrzymuje zapłatę – czy od nabywcy czy od osoby trzeciej. Ważne jest, aby było to wynagrodzenie za daną konkretną usługę lub za daną konkretną dostawę. W sytuacji zatem, gdy podatnik dla konkretnej dostawy towarów lub konkretnego świadczenia usług otrzymuje od innego podmiotu dofinansowanie, np. w postaci dotacji stanowiącej dopłatę do ceny towaru lub usługi – tego rodzaju dofinansowanie stanowi uzupełniający element podstawy opodatkowania z tytułu tej dostawy lub świadczenia. Natomiast dotacje mające na celu dofinansowanie ogólnych kosztów działalności, niedające się powiązać z konkretnymi czynnościami podlegającymi opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, a więc nieuzależnione od ilości i wartości dostarczanych towarów lub świadczonych usług, nie stanowią zapłaty w rozumieniu art. 29a ust. 1 ustawy o VAT, a tym samym nie wpływają na podstawę opodatkowania danej czynności. Należy przypomnieć, że z przedstawionego we wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej stanu faktycznego wynika, że wnioskodawca wraz z pozostałymi członkami konsorcjum zobowiązuje się wykonać określone prace w ramach opisanego we wniosku Zadania Badawczego. Na podstawie zawartych umów i regulaminu wykonawcy otrzymują środki pieniężne, które mają pokryć koszty ponoszone w związku z pracami objętymi projektem. W związku z otrzymaniem finansowania na rzecz realizacji projektu wnioskodawca zobowiązuje się przenieść na Skarb Państwa całość autorskich praw majątkowych do wszelkich efektów prowadzonych prac. W ocenie Sądu w opisanych we wniosku o wydanie interpretacji indywidulanej okolicznościach uznać należy, że dofinansowanie przekazane przez Fundusz na rzecz skarżącej ma za zadanie sfinansować prowadzone przez skarżącą badania naukowe w ramach projektu (Zadania Badawczego) ma charakter kosztowy. Organ niezasadnie przyjął (str. 41-42 zaskarżonej interpretacji), że o charakterze cenotwórczym przyznanego dofinasowania przemawia możliwość przeniesienia praw autorskich do własności intelektualnej powstałej w efekcie prowadzonych badań w ramach analizowanego Zadania Badawczego, które mogą finalnie być przedmiotem komercjalizacji, a wnioskodawca będzie uczestniczył w podziale wynagrodzenia otrzymanego z tego tytułu. Sąd zauważa, że w przypadku środków otrzymywanych z Funduszu jednym z podstawowych kryteriów przy rozpatrywaniu wniosków o dofinansowanie jest potencjalna (zakładana) komercjalizacja wyników dofinansowanego Zadania Badawczego. Wynika to m.in. ze szczególnej formy realizacji zadań badawczych w formie tzw. wirtualnego instytutu badawczego, który stanowi w ocenie ustawodawcy właściwą formę zapewniającą realizację określonego zadania badawczego w sposób umożliwiający komercjalizację osiągniętych wyników badawczych (art. 5 ust. 1 i ust. 2 ustawy o FPN). Dodatkowo zobowiązanie do współpracy przy komercjalizacji wyników pracy zespołów badawczych lub know-how związanego z tymi wynikami stanowi jeden z elementów koniecznych umowy o dofinansowanie (art. 11 pkt 4 ustawy o FPN). Inaczej rzecz ujmując, ustawodawca w wyraźny sposób ograniczył możliwość uzyskiwania dotacji z Funduszu do tych projektów badawczych, które z dużym prawdopodobieństwem umożliwią komercjalizację osiągniętych w ich ramach wyników pracy zespołów badawczych i know-how związanego z tymi wynikami. Jednak, zdaniem Sądu, ww. ograniczony zakres przedmiotowy przedsięwzięć badawczych, które mogą uzyskać dofinansowanie z Funduszu nie oznacza, iż uzyskane dofinasowanie z Funduszu ma bezpośredni wpływ na cenę towarów dostarczanych lub usług świadczonych przez skarżącą. Zdaniem Sądu, wobec tego, że właścicielem autorskich praw majątkowych powstałych w wyniku wykonania projektu, o którym mowa w stanie faktycznym przedstawionym we wniosku o wydanie interpretacji indywidulanej stanie się Skarb Państwa, a przeniesienie autorskich praw majątkowych na rzecz Skarbu Państwa nastąpi odpłatnie wyłącznie w razie ich późniejszej komercjalizacji, brak jest podstaw do stwierdzenia, iż dofinansowanie stanowi wynagrodzenie za świadczone usługi. Błędnie w tym zakresie DKIS przyjął, że w opisanym stanie faktycznym można mówić o skonkretyzowanej usłudze na rzecz MNISW, z a którą wynagrodzenie stanowi zarówno kwota przyznanego dofinansowania uzyskanego z Funduszu na realizację Zadania Badawczego, jak i część kwoty uzyskanej ze sprzedaży (komercjalizacji) rezultatów Zadania Badawczego. W szczególności niezasadne jest twierdzenie DKIS, że – wbrew podanemu przez wnioskodawcę opisowi zdarzenia przyszłego – w opisanych okolicznościach przekazanie praw własności intelektualnej na rzecz Skarbu Państwa odbywa się w istocie za wynagrodzeniem, którego część stanowi dofinansowanie z Funduszu. Stanowisko organu było nieuprawnione i błędne, bowiem z opisu zdarzenia przyszłego wynika, że realizacja Zadania Badawczego może zakończyć się bez wytworzenia własności intelektualnej, podlegającej przeniesieniu na Skarb Państwa (MNiSW). Tym samym nieprawidłowo organ argumentował o nierozłącznym związku dofinansowania z Funduszu i przeniesienia praw własności intelektualnej, skoro ten drugi element może nie powstać. Z opisu zdarzenia przyszłego wynika też, że dofinansowanie z Funduszu skarżąca ma przeznaczyć na określone koszty prowadzonych badań i środki te nie będą podlegać zwrotowi w razie niepowstania żadnej własności intelektualnej. To również przeczy tezie organu o tym, że dofinansowanie z Funduszu jest składnikiem ceny. W końcu zaś trudno zgodzić się z organem, że realizacja Zadania Badawczego stanowi świadczenie usługi na rzecz Instytutu P., którą miałaby być możliwość objęcia ochroną prawną wyników Zadania Badawczego i możliwość korzystania z tych wyników (str. 42 zaskarżonej interpretacji). Wobec tego, że owe wyniki Zadania Badawczego mogą nie powstać, rozumowanie organu pozostaje nieuprawnione. Podkreślenia wymaga, że o bezpośrednim związaniu dofinansowania z ceną można by mówić jedynie wtedy, gdyby Skarb Państwa nabywał, po określonej cenie, wyniki badań wnioskodawcy lub płacił, określoną cenę za samo prowadzenie tychże badań. Następnie, po uzyskaniu dofinansowania z Funduszu, cena, za jaką ostatecznie swoją usługę wnioskodawca sprzedałby Skarbowi Państwa, zależałaby od kwoty dofinansowania. Z wniosku o interpretację nie wynika, aby istniało powiązanie kwoty dofinansowania z ewentualnym, konkretnym wynikiem prac badawczych, które wskazywałoby na to, że dofinansowanie to stanowi dopłatę do ceny praw powstałych w toku prac badawczych, jako pokrycie części ich wartości lub rekompensatę z powodu obniżenia ceny. W niniejszej sprawie nie można zatem twierdzić, że dofinasowanie zostanie przyznane w związku z konkretnym świadczeniem. Wskazać należy, że z wniosku o wydanie interpretacji nie wynika, że dofinansowanie zostało przekazane, aby określony podmiot (Skarb Państwa) mógł nabyć określone świadczenie po obniżonej cenie. Umowa o dofinansowanie nie obliguje skarżącej do osiągnięcia określonego rezultatu, którego zakup miał być dofinansowany. Nie można zatem mówić o dofinansowaniu do ceny nabycia. Co istotne, w momencie przekazania dofinasowania nie wiadomo jeszcze, czy w ogóle zostanie wytworzona jakaś własność intelektualna nadająca się do komercjalizacji. Nie ma to jednak wpływu na rozliczenia dofinansowania z Funduszem. Ponadto środki z Funduszu nie będą stanowić wartości faktycznie przekazanej w zamian za realizację usługi. Skarżąca planuje zrealizować własną tezę badawczą, a nie zleconą czynność. Od Instytutu P. uzyskane zostaną środki na pokrycie kosztów tego badania. Zdaniem Sądu skarżąca (na etapie realizacji Zadania Badawczego) w ogóle nie będzie realizować czynności, które można uznać za świadczenia wykonywane za odpłatnością na rzecz Skarbu Państwa (MNiSW), Instytutu P., czy też innego podmiotu. Nie istnieje także cena jakiegokolwiek świadczenia. Nie występuje powiązanie kwoty dofinansowania z ewentualnym wynikiem Zadania Badawczego. W szczególności, jeśli w ramach realizacji Zadania Badawczego nie powstaną żadne prawa własności intelektualnej albo nie uda się ich skutecznie objąć ochroną prawną lub skomercjalizować – okoliczności te nie powodują obowiązku zwrotu dotacji. Również w przypadku uznania bezcelowości kontynuacji prac badawczych, członkowie konsorcjum nie zwracają dotychczas uzyskanego i prawidłowo wydatkowanego dofinansowania. Nie jest zatem uprawnione twierdzenie, że dofinansowanie z Funduszu stanowi dopłatę do ceny za przeniesienie własności, jako pokrycie części jej wartości lub rekompensatę z powodu obniżenia ceny. Przesądzający w tym względzie pozostaje brak korelacji między dofinansowaniem a konkretnym wynikiem prac badawczych, mogącej wskazywać, że dofinansowanie stanowi dopłatę do ceny praw powstających w ramach prowadzonego projektu. W ocenie Sądu nie można również uznać dofinasowania z Funduszu za wynagrodzenie za przeniesienie praw własności intelektualnej. Czynność ta będzie bowiem niezależna od faktu otrzymania dofinansowania na pokrycie kosztów realizacji Zadania Badawczego. Nie będzie konsekwencją otrzymanego dofinansowania, a przeprowadzonych prac badawczych. Nie można jej uznać za świadczenie wzajemne realizowane w zamian za dofinansowanie. Przeniesienie własności intelektualnej służyć bowiem będzie innym celom. Będzie niezbędne do przeprowadzenia kolejnej czynności, tj. dokonania przez Skarb Państwa (MNiSW) procesu komercjalizacji wyników badań. Podkreślić również należy, że wysokość przekazanych środków nie ma wpływu na warunki nabycia przez Skarb Państwa praw własności intelektualnej. Również powyższe okoliczności świadczą o braku możliwości uznania, że w rozpatrywanej sprawie zachodzą szczególne okoliczności pozwalające na uznanie tego rodzaju dofinansowania za dotację nie wchodzącą w zakres podstawy opodatkowania w rozumieniu art. 29a ust. 1 ustawy o VAT. Tym samym Sąd stwierdził, że w opisanym zdarzeniu przyszłym otrzymane dofinansowanie na realizację Zadania Badawczego, pochodzące ze środków Funduszu, nie będzie stanowiło podstawy opodatkowania podatkiem od towarów i usług w rozumieniu art. 29a ust. 1 ustawy o VAT, ani nie będzie wynagrodzeniem za świadczoną usługę. Wbrew stanowisku DKIS, opisany ciąg kolejnych zdarzeń nie powoduje, że – z punktu widzenia opodatkowania VAT – mamy do czynienia z jednym świadczeniem (usługą). Otrzymane dofinansowanie nie jest opodatkowana podatkiem od towarów i usług, gdyż nie wpływa bezpośrednio na cenę świadczonych usług. Powyższe sprawia, że dokonana przez organ ocena stanowiska wnioskodawcy, prowadząca do uznania, że kwota dofinansowania z Funduszu będzie wchodziła do podstawy opodatkowania, nie może zostać uznana za prawidłową, a tym samym za zasadne należało uznać podniesione w skardze zarzuty naruszenia art. 29a ust. 1 ustawy o VAT poprzez niewłaściwą ocenę co do zastosowania tego przepisu. Konsekwencją powyższego jest uwzględnienie również zarzutów dotyczących niewłaściwej oceny co do niezastosowania art. 8 ust. 2 pkt 2 w związku z art. 29a ust. 1 ustawy o VAT w zakresie oceny stanowiska skarżącej co do pytania nr 4. DKIS ocenę stanowiska wnioskodawcy w tej kwestii oparł na założeniu, że skarżąca, realizując Zadanie Badawcze, świadczy odpłatnie na rzecz Instytutu P. usługę (str. 45 zaskarżonej interpretacji). Jak już wywiedziono, założenie to było błędne, a tym samym należało uznać, że ocena DKIS co do niezastosowania art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT była nieprawidłowa z uwagi na przyjętą przez organ niewłaściwą ocenę co do zastosowania art. 29a ust. 1 ustawy o VAT. W tym stanie rzeczy Sąd na podstawie art. 146 § 1 p.p.s.a. w związku z art. 145 § 1 pkt 1 lit. a p.p.s.a. uchylił zaskarżoną interpretację w części, w której uznano stanowisko skarżącej za nieprawidłowe, o czym orzeczono w pkt I sentencji wyroku. Ponownie rozpoznając sprawę, DKIS zobowiązany będzie do oceny przedstawionego przez skarżącą zagadnienia z uwzględnieniem wykładni prawa wyrażonej przez Sąd w niniejszym uzasadnieniu wyroku. W pozostałej części skarga podlegała oddaleniu na podstawie art. 151 p.p.s.a., bowiem po pierwsze Sąd w warunkach związania zarzutami skargi nie odnalazł w skardze żadnych zarzutów wobec zaskarżonej interpretacji w części, w której organ uznał stanowisko skarżącej za prawidłowe (pytania nr 2 i nr 3). Po drugie Sąd nie podzielił zarzutu strony skarżącej co do naruszenia art. 14c § 1 i § 2 Ordynacji podatkowej. Zgodnie z tymi przepisami interpretacja indywidualna zawiera wyczerpujący opis przedstawionego we wniosku stanu faktycznego lub zdarzenia przyszłego oraz ocenę stanowiska wnioskodawcy wraz z uzasadnieniem prawnym tej oceny. Można odstąpić od uzasadnienia prawnego, jeżeli stanowisko wnioskodawcy jest prawidłowe w pełnym zakresie. W razie negatywnej oceny stanowiska wnioskodawcy interpretacja indywidualna zawiera wskazanie prawidłowego stanowiska wraz z uzasadnieniem prawnym. Zdaniem Sądu zaskarżona interpretacja zawierała powyższe – prawem wymagane – elementy. Poprzez zarzuty naruszenia art. 14c § 1 i § 2 o.p. można kwestionować kompletność elementów uzasadnienia interpretacji indywidualnej, a nie jej prawidłowość merytoryczną. Natomiast ewentualna wadliwość argumentacji organu, bądź prezentowanie przez stronę innego poglądu niż wskazany w uzasadnieniu interpretacji, nie stanowi o naruszeniu przez DKIS art. 14c § 1 i § 2 o.p. Brak przekonania strony o trafności rozstrzygnięcia sprawy, w tym co do przyjętego kierunku wykładni i oceny co do zastosowania przepisów prawa, której rezultat nie koresponduje z oczekiwaniami wnoszącego skargę, nie oznacza wadliwości uzasadnienia interpretacji, i to w stopniu mogącym mieć istotny wpływ na wynik sprawy. W tym stanie rzeczy Sąd, na podstawie art. 151 p.p.s.a., orzekł jak w pkt II sentencji wyroku. Zważywszy jednak na uwzględnienie skargi, w pkt III sentencji wyroku orzeczono również o kosztach postępowania na podstawie art. 200 p.p.s.a. oraz art. 205 § 2 p.p.s.a., zasądzając na rzecz strony skarżącej zwrot kosztów postępowania niezbędnych do celowego dochodzenia praw, obejmujący zwrot uiszczonego wpisu sądowego od skargi (200 zł) oraz kosztu poniesionego tytułem opłaty skarbowej od pełnomocnictwa (17 zł), a także wynagrodzenie pełnomocnika strony skarżącej będącego radcą prawnym (480 zł), wynikające z § 14 ust. 1 pkt 1 lit. c rozporządzenia Ministra Sprawiedliwości z dnia 22 października 2015 r. w sprawie opłat za czynności radców prawnych (Dz.U. z 2026 r. poz. 118). Reasumując, Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu orzekł jak w sentencji.

Źródło: Centralna Baza Orzeczeń Sądów Administracyjnych (orzeczenia.nsa.gov.pl), pozyskano 23.07.2026. · Źródło