II FSK 1018/25
WyrokNaczelny Sąd Administracyjny2026-01-27
Skład orzekający: Małgorzata Wolf-Kalamala, Maciej Jaśniewicz, Paweł Kowalski
Analiza orzeczenia
Sekcja wygenerowana przez AI na podstawie treści orzeczenia — nie stanowi cytatu.
Zagadnienie prawne
Czy organ interpretacyjny może pozostawić wniosek o wydanie interpretacji indywidualnej bez rozpatrzenia, wzywając podatnika do uzupełnienia stanu faktycznego o okoliczności, które stanowią element pytania interpretacyjnego lub do rozstrzygnięcia przez niego kwestii budzących wątpliwości prawne?Ratio decidendi
Organ interpretacyjny nie może pozostawić wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej bez rozpatrzenia, wzywając podatnika do uzupełnienia stanu faktycznego o okoliczności, które stanowią element pytania interpretacyjnego lub do rozstrzygnięcia przez niego kwestii budzących wątpliwości prawne. Wniosek o wydanie interpretacji indywidualnej powinien zostać pozostawiony bez rozpatrzenia jedynie w przypadku, gdy podatnik nie przedstawił wystarczających okoliczności faktycznych do oceny jego stanowiska prawnego.Stan faktyczny
Skarżący złożył wniosek o wydanie interpretacji indywidualnej w zakresie podatku dochodowego od osób fizycznych, pytając m.in. o kwalifikację projektów badawczo-rozwojowych oraz zaliczenie wydatków do kosztów kwalifikowanych. Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej (DKIS) uznał wniosek za zawierający braki formalne i wezwał do uzupełnienia wyjaśnień oraz przeformułowania pytania. Po uzupełnieniu wniosku, DKIS pozostawił go bez rozpatrzenia, uznając, że strona nie uzupełniła go w sposób umożliwiający merytoryczne wypowiedzenie się. Wojewódzki Sąd Administracyjny (WSA) w Krakowie oddalił skargę skarżącego, podzielając stanowisko organu.Rozstrzygnięcie
Uchylił zaskarżony wyrok w całości, uchylił zaskarżone postanowienie oraz poprzedzające je postanowienie Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej, zasądził od Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej na rzecz A. G. kwotę 1020 zł tytułem zwrotu kosztów postępowania kasacyjnego.Pełny tekst orzeczenia
Naczelny Sąd Administracyjny w składzie: Przewodniczący Sędzia NSA Małgorzata Wolf- Kalamala Sędziowie Sędzia NSA Maciej Jaśniewicz Sędzia WSA (del.) Paweł Kowalski (sprawozdawca) po rozpoznaniu w dniu 27 stycznia 2026 r. na posiedzeniu niejawnym w Izbie Finansowej skargi kasacyjnej A. G. od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Krakowie z dnia 27 lutego 2025 r. sygn. akt I SA/Kr 913/24 w sprawie ze skargi A. G. na postanowienie Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej z dnia 1 października 2024 r. nr [...] w przedmiocie pozostawienia bez rozpatrzenia wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej w zakresie podatku dochodowego od osób fizycznych 1) uchyla zaskarżony wyrok w całości, 2) uchyla zaskarżone postanowienie oraz poprzedzające je postanowienie Dyrektoria Krajowej Informacji Skarbowej z dnia 19 lipca 2024 r. nr. [...], 3) zasądza od Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej na rzecz A. G. kwotę 1020 (jeden tysiąc dwadzieścia) złotych tytułem zwrotu kosztów postępowania kasacyjnego.
Wojewódzki Sąd Administracyjny w Krakowie wyrokiem z 27 lutego 2025 r. w sprawie o sygn. akt I SA/Kr 913/24, oddalił skargę na postanowienie Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej z 1 października 2024 r. w przedmiocie pozostawienia bez rozpatrzenia wniosku A. G. o wydanie interpretacji indywidualnej.
Ze stanu sprawy przyjętego przez Sąd pierwszej instancji wynika, że skarżący we wniosku o wydanie interpretacji wystąpił o udzielenie odpowiedzi na następujące pytanie: "Czy realizowane w 2022 r. projekty badawczo-rozwojowe, szczegółowo opisane w części dotyczącej opisu stanu faktycznego, realizowane u wnioskodawcy, spełniają kryteria uznania prowadzonych czynności za działalność badawczo-rozwojową w rozumieniu art. 26e w związku z art. 5a pkt 38 ustawy z dnia 26 lipca 1991 r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (tekst jednolity: Dz. U. z 2024 r. poz. 226 ze zm., dalej: u.p.d.o.f.), a także w zakresie tego, czy poszczególne wydatki, ponoszone przez wnioskodawcę w ramach prowadzonych czynności badawczo-rozwojowych, mogą zostać zaliczone u wnioskodawcy do kosztów kwalifikowanych?"
Dyrektor KIS uznał, że wniosek zawiera braki formalne i wezwał stronę do ich uzupełnienia przez udzielenie szeregu wyjaśnień, a także przez zmianę treści zadanego pytania w taki sposób, aby wynikało z niego jakie skutki podatkowe chciałby wywieść z wydanej interpretacji.
Skarżący uzupełnił wniosek dwoma pismami, które wpłynęły do organu 18 i 26 czerwca 2024 r. Pytanie z jakim zwrócił się do organu po jego przeformułowaniu otrzymało następującą treść: "Czy realizowane w 2022 r. projekty badawczo-rozwojowe, szczegółowo opisane w części dotyczącej opisu stanu faktycznego, realizowane u wnioskodawcy, stanowią działalność badawczo-rozwojową w rozumieniu art. 5a pkt 38 u.p.d.o.f., a jeżeli tak to czy wykazane wydatki kwalifikowane podlegają odliczeniu od podstawy opodatkowania na podstawie art. 26e ust. 1 i 2 pkt 1, 2, 2a, a w przypadku projektu 640-11 Optymalizacja produkcji i systemu sterowania maszyny do pionowego parkowania samochodów w systemie samoobsługowym – V. art. 26 ust. 2a pkt 5 lit. a-d, art. 26 ust. 2a i 3, w związku z art. 26 ust. 5 u.p.d.o.f., zgodnie z którym koszty kwalifikowane podlegają odliczeniu, jeżeli nie zostały podatnikowi zwrócone w jakiejkolwiek formie (np. w postaci dotacji) lub nie zostały odliczone od podstawy obliczenia podatku?"
Dyrektor KIS postanowieniem z 19 lipca 2024 r. pozostawił wniosek bez rozpatrzenia, uznając, że strona nie uzupełniła tego wniosku w sposób, który umożliwiał merytoryczne wypowiedzenie się co do skutków podatkowych przedstawionych okoliczności sprawy, a tym samym wydanie interpretacji indywidualnej. Odnosząc się do zadanego pytania organ stwierdził, że w części dotyczącej projektu 640-11, pytanie dotyczy wątpliwości w odniesieniu do definicji działalności badawczo-rozwojowej oraz kosztów kwalifikowanych bez wskazania skutków podatkowych wynikających dla wnioskodawcy. Pytanie w tej części nie wskazuje, że przedmiotem interpretacji ma być możliwość skorzystania z ulgi badawczo-rozwojowej, a także możliwość odliczenia kosztów kwalifikowanych. Wnioskodawca powołał się również w swoim pytaniu na szereg przepisów, których nie ma w ustawie podatkowej (np. art. 26 ust. 2a pkt 5 lit. a-d, art. 26 ust. 2a i ust. 3).
Po rozpoznaniu zażalenia Dyrektor KIS postanowieniem z 1 października 2024 r. utrzymał w mocy zakwestionowane rozstrzygnięcie.
W skardze do WSA w Krakowie A. G. wniósł o uchylenie w całości obu postanowień Dyrektora, jako wydanych z naruszeniem: (1) art. 14b § 3, art. 14g § 1 w zw. z art. 169 § 1 i § 4 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (tekst jednolity: Dz. U. z 2019 r. poz. 900 ze zm.; dalej: o.p.) przez utrzymanie w mocy postanowienia o pozostawieniu bez rozpoznania wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej; (2) zasad postępowania, w szczególności art. 121 o.p., z którego wynika zasada prowadzenia postępowania podatkowego w sposób budzący zaufanie oraz zasada udzielania informacji.
W odpowiedzi na skargę organ interpretacyjny wniósł o jej oddalenie, podtrzymując swoje dotychczasowe stanowisko.
Sąd pierwszej instancji podzielił stanowisko zajmowane przez organ i oddalił skargę. Zdaniem Sądu stwierdzenie, czy podatnik prowadził działalność badawczo-rozwojową, wymagało doprecyzowania opisu stanu faktycznego sprawy. Tymczasem wyjaśnienia strony w tym zakresie nie były jednoznaczne. Skarżący nie zadeklarował jasno, czy wyodrębnia koszty działalności opisanej we wniosku w księgach handlowych (rachunkowych), nie dokonał również jednoznacznej kwalifikacji opisywanych czynności jako badań naukowych czy też prac rozwojowych. Wnioskodawca nie dopełnił zatem obowiązku przedstawienia w sposób wyczerpujący stanu faktycznego we wniosku o wydanie interpretacji. W konsekwencji organ interpretacyjny nie miał możliwości dokonania rzetelnej wykładni przepisów prawa materialnego wywołujących wątpliwości interpretacyjne podatnika. Zasadne było również, zdaniem Sądu, wezwanie skarżącego do przeformułowania zadanego pytania w taki sposób, aby wynikało z niego, jakie skutki podatkowe w zakresie ulgi badawczo-rozwojowej chciałby wywieść z faktu otrzymania interpretacji. Ostateczna wersja pytania skarżącego, w części dotyczącej "projektu 640-11 Optymalizacja produkcji i systemu sterowania maszyny do pionowego parkowania samochodów w systemie samoobsługowym – V. " sprowadzała się jedynie do jego wątpliwości w odniesieniu do przepisów dotyczących definicji działalności badawczo-rozwojowej oraz kosztów kwalifikowanych, bez wskazania skutków podatkowych jakie miałaby przynieść skarżącemu interpretacja podatkowa. Dodatkowo skarżący wskazał w pytaniu przepisy, których nie ma w ustawie o podatku dochodowym od osób fizycznych. Sąd pierwszej instancji nie dopatrzył się zatem naruszenia przez organ interpretacyjny przepisów art. 14b § 3, art. 14g § 1 oraz art. 169 § 4 o.p. Bezzasadny był również, zdaniem Sądu, zarzut naruszenia art. 121 o.p., ponieważ przepis ten nie miał zastosowania do postępowania wywołanego wnioskiem o wydanie interpretacji.
Od powyższego wyroku Sądu pierwszej instancji skargę kasacyjną wniósł pełnomocnik skarżącego (doradca podatkowy), który na podstawie art. 174 pkt 1 oraz art. 174 pkt 2 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (tekst jednolity: Dz.U. z 2023 r., poz. 1634 ze zm.; dalej: p.p.s.a.), zarzucił naruszenie:
(1) art. 145 § 1 pkt 1 lit. a) i c) p.p.s.a w zw. z art. 14g § 1, art. 14b § 1 i art. 14b § 3–3a w zw. z art. 14a § 2 pkt 1 i 2 , art. 14a § 5 oraz art. 121 § 1 o.p. poprzez bezpodstawne ustalenie, że w oparciu o opis stanu faktycznego zawarty w treści wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej, były podstawy do pozostawienia tego wniosku bez rozpatrzenia i przyznanie racji Dyrektorowi KIS, który odmówił wydania interpretacji indywidualnej, twierdząc że nie uzyskał informacji, o udzielenie której zwrócił się do skarżącego, co spowodowało, że wydanie interpretacji zgodnej z prawem okazało się niemożliwe, mimo że — zdaniem skarżącego — przedstawiony we wniosku (oraz uzupełnieniu) o wydanie indywidualnej interpretacji stan faktyczny opisujący zrealizowane przez skarżącego projekty badawczo-rozwojowe, został przedstawiony w sposób wyczerpujący, a przepisy podane w złożonym wniosku (art. 26e ust. 1 i 2) były prawidłowe. WSA, podobnie jak organ, nie uwzględnił wyjaśnienia skarżącego w zakresie "oczywistej pomyłki co do oznaczenia przepisu" i podkreślił w uzasadnieniu zaskarżonego postanowienia, że skarżący w tym pytaniu wskazał szereg przepisów, których nie ma w ustawie o podatku dochodowym od osób fizycznych, np. art. 26 ust. 2a pkt 5 lit. a-d, art. 26 ust. 2a i ust. 3, chociaż jak wynika z podstawy prawnej wskazanej w polu D wniosku O., wniosek dotyczył art. 26e ust. 1 i 2, co wskazywało na celowe unikanie zajęcia przez DKIS stanowiska w kwestii zasadniczej, tj. merytorycznego rozstrzygnięcia, czy opisane we wniosku prace przy projektach stanowią działalność badawczo-rozwojową zdefiniowaną w art. 5a pkt 38 u.p.d.o.f., a w dalszej kolejności — czy ponoszone na prace badawczo-rozwojowe wydatki mogą zostać zaliczone u wnioskodawcy do kosztów kwalifikowanych, a wnioskodawca może skorzystać z ulgi podatkowej zgodnie z przepisami zawartymi w art. 26e u.p.d.o.f. Przepisy, o których interpretację wnosił skarżący, zostały określone w w. 56 formularza O. i dotyczyły przepisów zdefiniowanych w art. 26e ust. 1 i 2 pkt 1, 2 i 2a u.p.d.o.f.;
(2) art. 141 § 4 p.p.s.a. w zw. z art. 124 oraz art. 169 § 1 o.p. poprzez brak wskazania/odniesienia na str. 18 wyroku, do poszczególnych jednostek redakcyjnych przepisu art. 169 § 1 o.p. (wskazanie konkretnych paragrafów) oraz przyznanie DKIS racji, jakoby miał prawo wezwać skarżącego do "przeformułowania zadanego we wniosku pytania w taki sposób, aby wynikało z niego jakie skutki podatkowe w zakresie ulgi badawczo-rozwojowej wnioskodawca chciałby wywieść z faktu otrzymania interpretacji indywidualnej", twierdząc jednocześnie w uzasadnieniu wyroku (str. 18), że "obowiązkiem organu podatkowego było bowiem dokonanie interpretacji przepisów prawa podatkowego na tle opisu stanu faktycznego lub zdarzenia przyszłego przedstawionego we wniosku o wydanie interpretacji. Jedyną możliwością ingerencji w przedstawiony przez wnioskodawcę opis stanu faktycznego lub zdarzenia przyszłego jest prawo organu do wezwania wnioskodawcy w oparciu o art. 14h w zw. z art 169 o.p., do uzupełnienia jego opisu, w sytuacji gdy nie pozwala on na niebudzące wątpliwości zastosowanie przepisów materialnego prawa podatkowego, organy podatkowe nie są uprawnione do dowodowego ustalania i weryfikowania stanu faktycznego dochodzonej przez wnioskodawczynię interpretacji indywidualnej czy dokonania jakichkolwiek modyfikacji wniosku, czy przedstawionego stanu faktycznego". WSA, zdaniem strony, z jednej strony twierdzi, że z art. 14b § 3 o.p. wynika, że przedstawiony we wniosku stan faktyczny stanowi jedyną faktyczną podstawę udzielonej interpretacji i tym samym wyznacza granice, w jakich interpretacja będzie mogła wywoływać określone w ustawie skutki prawne a organ interpretujący "porusza się" niejako tylko i wyłącznie w ramach stanu faktycznego przedstawionego przez wnioskodawcę oraz wyrażonej przez niego oceny prawnej, a z drugiej nie zauważa, że DKIS żąda informacji wykraczającej lub niezrozumiałej dla skarżącego, poza zdefiniowane pytanie.
W oparciu o tak skonstruowane zarzuty skarżący wniósł o uchylenie zaskarżonego wyroku w całości i przekazanie sprawy do ponownego rozpoznania Wojewódzkiemu Sądowi Administracyjnemu w Krakowie oraz zasądzenie kosztów postępowania kasacyjnego, w tym kosztów zastępstwa procesowego według norm prawem przepisanych.
W odpowiedzi na skargę kasacyjną pełnomocnik Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej wniósł o jej oddalenie i zasądzenie kosztów postępowania, w tym kosztów zastępstwa procesowego według norm przepisanych.
Naczelny Sąd Administracyjny zważył, co następuje:
Skarga kasacyjna zasługuje na uwzględnienie.
Kwestią sporną w sprawie jest, czy na podstawie art. 169 § 1 w zw. z art. 14h o.p. można żądać od podatnika ubiegającego się o interpretację indywidualną, wyjaśnień co do kwestii, które nie budzą jego wątpliwości prawnych (sposób wyodrębnienia kosztów działalności) oraz żądać od niego, aby we własnym zakresie rozstrzygnął kwestie, które budzą jego wątpliwości (to jest czy podejmowane przez wnioskodawcę czynności stanowią działalność badawczo-rozwojową w rozumieniu art. 5a pkt 38 u.p.d.o.f.).
Naczelny Sąd Administracyjny zgadza się ze skarżącym, że w wezwaniu do sprecyzowania wniosku nie można żądać uzupełnienia stanu faktycznego o te okoliczności, także prawnie znaczące, które stanowiły element pytania, zawartego we wniosku o wydanie interpretacji. Organ mógł jedynie żądać sprecyzowania danych faktycznych dotyczących prowadzonej działalności niezbędnych do ich oceny w kontekście definicji działalności badawczo-rozwojowej.
Powyższa problematyka wielokrotnie była już przedmiotem wypowiedzi Naczelnego Sądu Administracyjnego, który w tym zakresie wypracował jednolitą linię orzeczniczą (por. wyroki NSA z 13 stycznia 2022 r., II FSK 1333/21; z 17 grudnia 2021 r., II FSK 1239/21; z 23 listopada 2021 r., II FSK 1049/21; z 1 czerwca 2022 r., II FSK 1072/21; z 20 kwietnia 2023 r., II FSK 484/22), wobec czego w rozpatrywanej sprawie wykorzystana została argumentacja zawarta w przywołanych orzeczeniach.
Zgodnie z art. 14b § 3 o.p. składający wniosek o wydanie interpretacji indywidualnej obowiązany jest do wyczerpującego przedstawienia zaistniałego stanu faktycznego albo zdarzenia przyszłego oraz do przedstawienia własnego stanowiska w sprawie oceny prawnej tego stanu faktycznego albo zdarzenia przyszłego. Stosownie natomiast do art. 14h o.p. w sprawach dotyczących interpretacji indywidualnej stosuje się odpowiednio m.in. przepisy art. 120, art. 121 § 1, art. 165a oraz art. 169 § 1–2 i 4 o.p., a nadto przepisy rozdziału 6 działu IV tej ustawy. Zgodnie z art. 169 § 1 o.p. jeżeli podanie nie spełnia wymogów określonych przepisami prawa, organ podatkowy wzywa wnoszącego podanie do usunięcia braków w terminie 7 dni, z pouczeniem, że niewypełnienie tego warunku spowoduje pozostawienie podania bez rozpatrzenia. Postępowanie w sprawach z wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej zasadniczo różni się od postępowania podatkowego. W szczególności organ interpretacyjny nie jest zobowiązany do podejmowania wszelkich niezbędnych działań w celu dokładnego wyjaśnienia stanu faktycznego (art. 122 o.p. nie ma zastosowania), a wzywa wnioskodawcę do uszczegółowienia stanu faktycznego jedynie w sytuacji, gdy podany stan faktyczny uniemożliwia odpowiedź na pytanie zawarte we wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej (por. wyrok NSA z 9 stycznia 2019 r., II FSK 3537/15). Wymóg wyczerpującego przedstawienia stanu faktycznego albo zdarzenia przyszłego realizuje się poprzez podanie wszystkich jego elementów, istotnych z punktu widzenia możliwości oceny stanowiska wnioskodawcy. W trybie żądania uzupełnienia braków formalnych pisma, jakim jest wniosek o wydanie interpretacji indywidualnej, organ podatkowy może żądać jedynie uzupełnienia wniosku o takie elementy, bez których nie jest możliwa ocena, czy stanowisko przedstawione we wniosku i ocena prawna są prawidłowe czy też błędne. Elementy te organ podatkowy powinien precyzyjnie wskazać w wezwaniu, wyjaśniając dlaczego ich brak uniemożliwia wydanie interpretacji indywidualnej. Interpretacja indywidualna ma bowiem na celu uzyskanie stanowiska organu podatkowego w zakresie rozumienia przepisów prawa podatkowego na gruncie przedstawionego przez wnioskodawcę, a nie ustalenie przez organ podatkowy, stanu faktycznego lub zdarzenia przyszłego. Wymaga podkreślenia, że wyczerpująco przedstawiony stan faktyczny (zaistniały bądź przewidywany), to taki, na podstawie, którego można w sposób pewny i nieuzasadniający żadnych wątpliwości, udzielić informacji w zakresie możliwości zastosowania prawa podatkowego w indywidualnej sprawie.
Odnosząc powyższe rozważania do realiów niniejszej sprawy, zdaniem Naczelnego Sądu Administracyjnego, skarżący we wniosku o wydanie interpretacji oraz w odpowiedziach na wezwania organu wywiązał się z obowiązku wyczerpującego przedstawienia stanu faktycznego, a organ interpretacyjny nie miał podstaw do wydania postanowienia o pozostawieniu bez rozpatrzenia wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej na podstawie art. 14g § 1 o.p. Ze stanowiska wielokrotnie wyrażanego w orzecznictwie wynika w sposób dostatecznie czytelny, że w postępowaniu zmierzającym do wydania interpretacji indywidualnej organ podatkowy związany jest zakresem pytania sformułowanego przez wnioskodawcę w relacji do podanego we wniosku stanu faktycznego lub zdarzenia przyszłego. Organ wydający interpretację indywidualną może się poruszać jedynie w ramach tego pytania i stanu faktycznego albo zdarzenia przyszłego, które zakreślają przedmiot postępowania interpretacyjnego.
Problem interpretacyjny, z którym wystąpił skarżący, dotyczył przede wszystkim kwestii zakwalifikowania realizowanych przez niego projektów do działalności badawczo-rozwojowej, o której mowa w art. 5a pkt 38 u.p.d.o.f. Wyjaśnienie tej kwestii zostało powiązane przez wnioskodawcę z możliwością skorzystania z tzw. ulgi badawczo-rozwojowej, mierzonej wysokością kosztów kwalifikowanych określonych w art. 26e u.p.d.o.f. Zagadnienie prawne nakreślone postawionym we wniosku pytaniem odnosiło się zatem w pierwszej kolejności do możliwości uznania podejmowanej przez skarżącego działalności, za działalność badawczo-rozwojową w rozumieniu art. 5a pkt 38 u.p.d.o.f. Natomiast organ interpretacyjny skierował do skarżącego wezwanie m.in. do udzielenia wyjaśnień w zakresie tego w jaki sposób wyodrębnia w prowadzonych księgach handlowych (rachunkowych) koszty działalności opisanej we wniosku w celu skorzystania z odliczenia, o którym mowa w art. 26e u.p.d.o.f., a także do której z kategorii kosztów kwalifikowanych z art. 26e u.p.d.o.f. zalicza każdy z tych wydatków.
W orzecznictwie sądów administracyjnych wyrażany jest pogląd, że element wprawdzie objęty normą prawnopodatkową, ale podany przez wnioskodawcę w ramach "wyczerpującego przedstawienia zaistniałego stanu faktycznego albo zdarzenia przyszłego" jako faktycznie występujący i co do którego tenże wnioskodawca nie wyraża w jednoznaczny sposób wątpliwości prawnych, nie może być przedmiotem weryfikacji prowadzonej przez organ. Podkreśla się także, że w postępowaniu o wydanie interpretacji indywidualnej wnioskodawca według własnego uznania podejmuje swobodną decyzję co do tego, o jaką kwestię podatkową pyta i w otoczeniu jakich okoliczności (zaistniałego stanu faktycznego albo zdarzenia przyszłego) do tej kwestii się odnoszących. W konsekwencji "to samo" jednym razem jest tylko elementem stanu faktycznego albo zdarzenia przyszłego, a innym razem może być już ważną częścią prawną interpretacji indywidualnej, w której wnioskodawca oczekuje oceny swojego stanowiska w ramach merytorycznej wypowiedzi organu podatkowego (por. postanowienie składu siedmiu sędziów NSA z 20 stycznia 2020 r., I FPS 3/19).
W tym kontekście, zawarte we wniosku zapewnienie skarżącego, że prowadził odrębną ewidencję kosztów kwalifikowanych, przypisanych do numerów konkretnych projektów badawczo-rozwojowych, umożliwiającą dokładne śledzenie wydatków związanych z każdym przedsięwzięciem, należało uznać za wyczerpujące przedstawienie stanu faktycznego, w sytuacji gdy właściwym przedmiotem wątpliwości podatnika była prawidłowa kwalifikacja poniesionych wydatków, nie zaś sposób ich ewidencjonowania. Podobnie, wyszczególnienie przez wnioskodawcę wydatków poniesionych na prace badawcze (B) oraz tych, poniesionych na prace rozwojowe (R), jednoznacznie zakreślało stan faktyczny sprawy i nie dawało organowi interpretującemu podstaw domagania się od wnioskodawcy dodatkowych wyjaśnień. Nie było również podstaw do wzywania wnioskodawcy do przeformułowania zadanego we wniosku pytania w taki sposób, aby wynikało z niego jakie skutki podatkowe w zakresie ulgi badawczo-rozwojowej wnioskodawca chciałby wywieść z faktu otrzymania interpretacji indywidualnej. W ocenie Naczelnego Sądu Administracyjnego z samej treści pierwotnego pytania zawartego we wniosku wynikało wprost, że celem złożenia wniosku nie była jedynie chęć zaspokojenia ciekawości podatnika, ale uzyskanie jednoznacznego stanowiska organu interpretującego w zakresie kwalifikacji podatkowej ściśle określonych, poniesionych już przez podatnika, wydatków. Rację ma zatem strona skarżąca podnosząc, że kwestia zaliczenia zrealizowanych prac do działalności badawczo-rozwojowej określonej w art. 5a pkt 38 u.p.d.o.f. była pierwszym krokiem, aby podatnik mógł rozważać możliwość skorzystanie z tzw. ulgi badawczo-rozwojowej. Wzywanie w tej sytuacji wnioskodawcy do przeformułowania pytania zawartego we wniosku nie miało prawnego uzasadnienia.
W ocenie Naczelnego Sądu Administracyjnego organ, wzywając skarżącego do uzupełnienia wniosku na podstawie art. 169 § 1 w zw. z art. 14h o.p., domagał się w istocie od skarżącego, aby uzupełnił stan faktyczny, w ten sposób, aby prowadzenie przez niego działalności badawczo-rozwojowej stało się elementem tego stanu. Tymczasem ewentualne wezwanie do sprecyzowania wniosku nie może prowadzić do żądania, aby to sam wnioskodawca, przesądził kwestię, o którą wprost zapytał, lecz jedynie do sprecyzowania danych faktycznych dotyczących prowadzonej działalności, niezbędnych do ich oceny w kontekście definicji owej działalności. W rozpoznawanej sprawie rzeczą organu była ocena działalności podatnika na gruncie obowiązujących przepisów, a pozostawienie wniosku bez rozpoznania dopuszczalne byłoby tylko w przypadku, jeśli wnioskodawca nie przedstawiłby wystarczających okoliczności faktycznych do tej oceny. Skoro skarżący opisał swoją działalność przez pryzmat cech działalności badawczo-rozwojowej, to organ miał obowiązek udzielić odpowiedzi na przedstawioną wątpliwość. Od takiej oceny jednak się uchylił, co stanowi naruszenie art. 14b § 3 o.p. To właśnie aspekt wykonywania przez skarżącego działalności badawczo-rozwojowej wymaga w rozpatrywanej sprawie wyjaśnienia i interpretacji. Nie może on zatem zostać uznany jako element stanu faktycznego, którego podanie obciąża wnioskodawcę jako podatnika. Z tego powodu zarzuty i argumentacja skargi kasacyjnej podważają stanowisko sądu pierwszej instancji, a także stanowisko zajęte przez organ interpretacyjny.
Podsumowując Naczelny Sąd Administracyjny stwierdza, że w rozpoznawanej sprawie organ interpretacyjny nie miał podstaw, aby wzywać skarżącego w trybie art. 169 § 1 o.p. do precyzowania informacji, które zostały już wyczerpująco przedstawione we wniosku, stosownie do art. 14b § 3 o.p., ani też do przeformułowania pytania zadanego we wniosku o wydanie interpretacji. Był zaś zobowiązany do oceny przedstawionego stanu faktycznego i udzielenia odpowiedzi merytorycznej, dotyczącej wątpliwości prawnych skarżącego. Sąd pierwszej instancji rozpoznając skargę nie dostrzegł uchybień organu interpretacyjnego. Tym samym za zasadne należy uznać zarzuty naruszenia przepisów postępowania wskazane w skardze kasacyjnej.
Spełnione również zostały przesłanki do zastosowania art. 188 p.p.s.a., ponieważ istota sprawy została dostatecznie wyjaśniona.
Naczelny Sąd Administracyjny uchylił zatem, na podstawie art. 188 p.p.s.a., zaskarżony wyrok w całości, a w wyniku rozpoznania skargi uchylił również zaskarżone do WSA postanowienie, a także postanowienie wydane przez organ w pierwszej instancji, na podstawie art. 145 § 1 pkt 1 lit. c p.p.s.a., jako wydane z naruszeniem art. 14b § 3 o.p. w stopniu, o którym mowa w tym przepisie.
Ponownie rozpoznając sprawę Dyrektor KIS obowiązany będzie uwzględnić powyższe rozważania i dokonać oceny stanowiska skarżącego, czy prowadzi działalność badawczo-rozwojową w rozumieniu m.in. art. 5a pkt 38 u.p.d.o.f.
Podstawę rozstrzygnięcia o kosztach postępowania sądowego stanowiły art. 200, art. 209, art. 203 pkt 1, art. 205 § 2 i § 4 p.p.s.a. w zw. § 2 ust. 1 pkt 2 i ust. 2 pkt 1 rozporządzenia Ministra Sprawiedliwości z 16 sierpnia 2018 r. w sprawie wynagrodzenia za czynności doradcy podatkowego w postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz.U. z 2018 r., poz. 1687).
Źródło: Centralna Baza Orzeczeń Sądów Administracyjnych (orzeczenia.nsa.gov.pl), pozyskano 13.07.2026. · Źródło